RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 SUSD1Q6UWL2 747 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 ANKS3Q6ZW76 656 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 FAM181AQ8N9Y4 354 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 HSH2DQ96JZ2 352 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 TBL1XO60907 577 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 CDKN2CP42773 168 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 TTPAP49638 278 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 RORCP51449 518 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 ITGA1P56199 1179 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 HMGCS1Q01581 520 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 MADCAM1Q13477 382 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM65Q6PI78 240 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 FAM217AQ8IXS0 508 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 B3GNT7Q8NFL0 401 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 VWCEQ96DN2 955 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 GPR63Q9BZJ6 419 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 ING3Q9NXR8 418 aa23.66■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 FFAR3O14843 346 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 GPR42O15529 346 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 TNFRSF21O75509 655 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 MFSD13AQ14CX5 517 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 LRIF1Q5T3J3 769 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 TAPBPLQ9BX59 468 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 VN1R3Q9BXE9 311 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 ADGRE3Q9BY15 652 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 MS4A12Q9NXJ0 267 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 ESR1P03372 595 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 PDZK1Q5T2W1 519 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 ADGRF1Q5T601 910 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 PLET1Q6UQ28 207 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 APOL5Q9BWW9 433 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 ABCB9Q9NP78 766 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 RIMKLBQ9ULI2 386 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 PRSS21Q9Y6M0 314 aa23.65■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1B0GVM2 712 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 SEC14L5O43304 696 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 GABRB1P18505 474 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 GPC1P35052 558 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 HSPA7P48741 367 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 CLCN7P51798 805 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 RHOAP61586 193 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 DMC1Q14565 340 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 TAF12Q16514 161 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 DOK6Q6PKX4 331 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 CIPCQ9C0C6 399 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 KCNH6Q9H252 994 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 KCNN2Q9H2S1 579 aa23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
PKDCC-201ENST00000294964 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 SLC22A5O76082 557 aa23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 CXCL10P02778 98 aa23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 ICAM2P13598 275 aa23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 PRKACAP17612 351 aa23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 TNNI3P19429 210 aa23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 PTPN6P29350 595 aa23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 ZXDBP98169 803 aa23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 SGO1Q5FBB7 561 aa23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 LHFPL5Q8TAF8 219 aa23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 MCUBQ9NWR8 336 aa23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 AUP1Q9Y679 476 aa23.64■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 CIB4A0PJX0 185 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 H7C4K7 107 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 WEE1P30291 646 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 SSTR4P31391 388 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 RUNX1T1Q06455 604 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 NCEH1Q6PIU2 408 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 C9orf62Q8N4C0 152 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 CCM2Q9BSQ5 444 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 SPATA9Q9BWV2 254 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 MIXL1Q9H2W2 232 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 EVA1BQ9NVM1 165 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 LHX3Q9UBR4 397 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 KCNE2Q9Y6J6 123 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 GALNT11Q8NCW6 608 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 BTN2A2Q8WVV5 523 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 AUTS2Q8WXX7 1259 aa23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PKDCC-201ENST00000294964 MSANTD3Q96H12 275 aa23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms