RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf109Q9NX04 203 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX6Q9UNH7 406 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MED16Q9Y2X0 877 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PQU0 124 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MANBAO00462 879 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SOCS2O14508 198 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GNGT2O14610 69 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LSM1O15116 133 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SEC22BO75396 215 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TRMUO75648 421 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 AP2A2O94973 939 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ACPPP15309 386 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CTPS1P17812 591 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 IL1RNP18510 177 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 S100A3P33764 101 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ETV5P41161 510 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPA7P48741 367 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 AP1S2P56377 157 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R38P59533 333 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ECT2LQ008S8 904 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAF3Q13114 568 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MYLK3Q32MK0 819 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC36A3Q495N2 470 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ATG9BQ674R7 924 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SBSNQ6UWP8 590 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LINGO4Q6UY18 593 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GCNT7Q6ZNI0 430 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZSR9 355 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DSG4Q86SJ6 1040 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CROCCP3Q8IVE0 287 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NXPE1Q8N323 547 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF786Q8N393 782 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SFRP1Q8N474 314 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SNX31Q8N9S9 440 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM47BQ8NA70 645 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FIBINQ8TAL6 211 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LMX1AQ8TE12 382 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ATL1Q8WXF7 558 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 VPS50Q96JG6 964 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGED4Q96JG8 741 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LMLNQ96KR4 655 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF145Q96MT1 663 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LYSMD1Q96S90 227 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 COPS8Q99627 209 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC30A3Q99726 388 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC29A1Q99808 456 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBA1CQ9BQE3 449 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ING2Q9H160 280 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ADNPQ9H2P0 1102 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OLAHQ9NV23 265 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SMOXQ9NWM0 555 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 KLF15Q9UIH9 416 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.76□□□□□ -1.33
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