RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 C17orf62Q9BQA9 187 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 IKZF5Q9H5V7 419 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 SYNPO2LQ9H987 977 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 A0A1B0GVT2 93 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 CTSVO60911 334 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 EPN2O95208 641 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ATP6V1B2P21281 511 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 LSSP48449 732 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 SESN3P58005 492 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 OR4D2P58180 307 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 PMS2CLQ68D20 193 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF793Q6ZN11 406 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 CALHM3Q86XJ0 350 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 FAM47BQ8NA70 645 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 OR2T12Q8NG77 320 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 OR10A6Q8NH74 314 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 GAB3Q8WWW8 586 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 MIEF1Q9NQG6 463 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 EVA1BQ9NVM1 165 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 POMT2Q9UKY4 750 aa15.99■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 EVPLLA8MZ36 301 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 CLIC1O00299 241 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 NVLO15381 856 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 UBXN7O94888 489 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 DRD2P14416 443 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 GNSP15586 552 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 PPIBP23284 216 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 SLC7A1P30825 629 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 CTSKP43235 329 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 GZMMP51124 257 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ABHD18Q0P651 414 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 SLC9A5Q14940 896 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 MPEG1Q2M385 716 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 MUM1Q2TAK8 710 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 DEFB133Q30KQ1 61 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 TICAM1Q8IUC6 712 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 SPPL2CQ8IUH8 684 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 C1orf210Q8IVY1 113 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 AMER3Q8N944 861 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 NRG4Q8WWG1 115 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 RSC1A1Q92681 617 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 GAL3ST3Q96A11 431 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 FCRL4Q96PJ5 515 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 MACROD1Q9BQ69 325 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 PCDHGB4Q9UN71 923 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 EML5Q05BV3 1969 aa15.98■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 A0A0J9YVX5 310 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 C1orf226A1L170 272 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 FAM220BPB1ANY3 271 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 C4orf51C9J302 202 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 SDC3O75056 442 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 GUCY1B2O75343 617 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 SCELO95171 688 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 STATHP02808 62 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 FAM58BPP0C7Q3 252 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 SLC35G6P0C7Q6 338 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 TYRP1P17643 537 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ENGP17813 658 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 GPX2P18283 190 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 GGT1P19440 569 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 VHLP40337 213 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 RXRGP48443 463 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 BIRC2Q13490 618 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 C14orf28Q4W4Y0 310 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 MANEAQ5SRI9 462 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 GLYATQ6IB77 296 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 RNF44Q7L0R7 432 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ACOT4Q8N9L9 421 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 CAMKVQ8NCB2 501 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 SLC38A3Q99624 504 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 ABCG4Q9H172 646 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 SEMA6CQ9H3T2 930 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 PIF1Q9H611 641 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 UCKL1Q9NWZ5 548 aa15.97■□□□□ 0.15
TVP23C-201ENST00000225576 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms