RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000182527.3

TRAM2-201, Transcript of translocation associated membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAM2, Length 6,908 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-201ENST00000182527 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 LRRC58Q96CX6 371 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 KLK13Q9UKR3 277 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 FGF4P08620 206 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 CSNK2BP67870 215 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 C2orf80Q0P641 193 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 TMEM65Q6PI78 240 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ZFP90Q8TF47 636 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 C1orf54Q8WWF1 131 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 RNFT2Q96EX2 444 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ERP44Q9BS26 406 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 HDAC8Q9BY41 377 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 TMEM184CQ9NVA4 438 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 PLAAQ9Y263 795 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 K7ESM1 405 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 BTN3A3O00478 584 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 PPEF2O14830 753 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 HRO43593 1189 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ATE1O95260 518 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 C1QTNF9P0C862 333 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 SIAH1Q8IUQ4 282 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 OR5B17Q8NGF7 314 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 OR4C6Q8NH72 309 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 PTTG2Q9NZH5 202 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 A0A1W2PRG6 482 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 KCNK1O00180 336 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 FCGR1AP12314 374 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 GABRG2P18507 467 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ETV3P41162 512 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 GABRA2P47869 451 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 FAM189BP81408 668 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 PIGTQ969N2 578 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 TPD52L3Q96J77 140 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF583Q96ND8 569 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 SLC6A17Q9H1V8 727 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 CKLFQ9UBR5 152 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 SEMA3DO95025 777 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 STATHP02808 62 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 UCHL3P15374 230 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 IL3RAP26951 378 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 CXCR5P32302 372 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 MTTPP55157 894 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 TLE1Q04724 770 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 SLC18A2Q05940 514 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 GGTLC2Q14390 218 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ANXA8L1Q5VT79 327 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 GALNT16Q8N428 558 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 PSKH2Q96QS6 385 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 C12orf49Q9H741 205 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 TTC26A0AVF1 554 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 GLRA3O75311 464 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 IFNW1P05000 195 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 SPARCP09486 303 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 CD70P32970 193 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 SLC12A3P55017 1021 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 PARP6Q2NL67 630 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 PRMT9Q6P2P2 845 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 SCAMP4Q969E2 229 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 NUDT9Q9BW91 350 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 CHST7Q9NS84 486 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 IL20RAQ9UHF4 553 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 TRIM77I1YAP6 450 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 FAM87AP0C7U9 286 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 CTBSQ01459 385 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAM2-201ENST00000182527 KIR2DS3Q14952 304 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms