RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028386.11

Nckap1-201, Transcript of Nck-associated protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nckap1, Length 4,469 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Stfa2l1Q8BWM3 103 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Dpep2Q8C255 478 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Colec10Q8CF98 277 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tmbim6Q9D2C7 237 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 S100a14Q9D2Q8 104 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Upk1bQ9Z2C6 260 aa20.36■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rps26P62855 115 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Fezf1Q0VDQ9 475 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cox8aQ64445 69 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Kcng4Q80XM3 506 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Fam72aQ8BFZ8 149 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Fam109aQ8BH49 266 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Las2Q8CB14 526 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cbr4Q91VT4 236 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Acsl6Q91WC3 697 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gpr37l1Q99JG2 481 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Med27Q9DB40 311 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Jph3Q9ET77 744 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Znf382B2RXC5 579 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 UqcrhP99028 89 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Elmod1Q3V1U8 326 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Vdac3Q60931 283 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 C1qtnf6Q6IR41 264 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Map4k5Q8BPM2 847 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Izumo1Q9D9J7 397 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Jph1Q9ET80 660 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Asb4Q9WV71 426 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mtnd5P03921 607 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Apoa2P09813 102 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Wipi2Q80W47 445 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cst13Q80ZN5 141 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc5a9Q8VDT1 685 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Krt81Q9ERE2 481 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Sh3bgrlQ9JJU8 114 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gmeb2P58929 530 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Bop1P97452 732 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Xrcc1Q60596 631 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 FukQ7TMC8 1090 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 AasdhQ80WC9 1100 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 AcmsdQ8R519 336 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr801Q8VEU1 318 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cdkal1Q91WE6 578 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Adgrl4Q923X1 739 aa20.35■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm9857F7CXR1 130 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 OsmrO70458 971 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tsc22d1P62500 1077 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Traf6P70196 530 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rgs16P97428 201 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 MedagQ14BA6 303 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Sema3gQ4LFA9 780 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 CpmQ80V42 443 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 IfneQ80ZF2 192 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Snx11Q91WL6 271 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Lrrc72A0A1Y7VMI0 288 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gm6592A2AHC7 168 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rex2A2AWF2 685 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 RykQ01887 594 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ipcef1Q5DU31 406 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Sall4Q8BX22 1067 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 RfkQ8CFV9 155 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tmem185bQ8R3R5 350 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Rab14Q91V41 215 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 B3galt5Q9JI67 308 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 9630041A04RikD3Z3U4 205 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cx3cl1O35188 395 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 F2P19221 618 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Pyroxd2Q3U4I7 581 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc5a6Q5U4D8 634 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Nr1d2Q60674 576 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zic5Q7TQ40 622 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Jazf1Q80ZQ5 243 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Slc6a17Q8BJI1 727 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Mblac2Q8BL86 279 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 SowahcQ8C0J6 512 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Grhl2Q8K5C0 625 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Pcdhb3Q91XZ7 784 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tmprss6Q9DBI0 811 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa20.34■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Ankrd37Q569N2 159 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Znf410Q8BKX7 478 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Asb18Q8VHA6 467 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zfp738B8JJX8 793 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 BdnfP21237 249 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Itih2Q61703 946 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Tex13c3Q810P0 219 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 EndovQ8C9A2 338 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Zfyve21Q8VCM3 234 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Epsti1Q8VDI1 314 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr599Q8VG01 315 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Olfr643Q8VGY1 314 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Sh3bp4Q921I6 962 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Prkar1aQ9DBC7 381 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Nme7Q9QXL8 395 aa20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Eif4hQ9WUK2 248 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Gp5O08742 567 aa20.33■□□□□ 0.84
Nckap1-201ENSMUST00000028386 Cyp2j5O54749 501 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59.5 ms