RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	SARG	Q9BW04	601 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PPT2	Q9UMR5	302 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CLDN4	O14493	209 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	NEURL1	O76050	574 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	B3GALT4	O96024	378 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	MAOA	P21397	527 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	GABRB3	P28472	473 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SSTR2	P30874	369 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ELK3	P41970	407 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CLCN2	P51788	898 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ITGA8	P53708	1063 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ARL4C	P56559	192 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SHISA5	Q8N114	240 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	KRT78	Q8N1N4	520 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	OR4K3	Q96R72	315 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	NPAS2	Q99743	824 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	OLFM1	Q99784	485 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	MYO1D	O94832	1006 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	WDR47	O94967	919 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TPO	P07202	933 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SERPINA6	P08185	405 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	HNMT	P50135	292 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	MEOX1	P50221	254 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	HLCS	P50747	726 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	MLF1	P58340	268 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	BTN3A2	P78410	334 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	BTG2	P78543	158 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	HSF1	Q00613	529 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21	6e-7	■■□□□ 11.7
TARDBP-231	ENST00000639599	HYAL2	Q12891	473 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC13A2	Q13183	592 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	RCN2	Q14257	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRC39	Q96DD0	335 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	LURAP1	Q96LR2	239 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SNX12	Q9UMY4	172 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599		E9PLN8	166 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CES2	O00748	559 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	GNAZ	P19086	355 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PTGS2	P35354	604 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TGM3	Q08188	693 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PAOX	Q6QHF9	649 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	VMP1	Q96GC9	406 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599		A8MVJ9	347 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ACOT7	O00154	380 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	CLGN	O14967	610 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	FANCG	O15287	622 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TARDBP-231	ENST00000639599	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21

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