RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 IRF4Q15306 451 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 MED22Q15528 200 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 LEXMQ3ZCV2 418 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 AMER3Q8N944 861 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PROX1Q92786 737 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SRMSQ9H3Y6 488 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SCN3BQ9NY72 215 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CA14Q9ULX7 337 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 COL6A3P12111 3177 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SLC35F4A4IF30 521 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 H3BSH0 61 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 NUAK1O60285 661 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 LATS1O95835 1130 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 OR12D1P0DN82 309 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SHMT2P34897 504 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PSMD7P51665 324 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 HPCAP84074 193 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 EPS8Q12929 822 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 GAB1Q13480 694 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ANKRD54Q6NXT1 300 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CEP68Q76N32 757 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 STX19Q8N4C7 294 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ITFG2Q969R8 447 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PYURFQ96I23 114 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TMEM168Q9H0V1 697 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 AHSPQ9NZD4 102 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SELENONQ9NZV5 590 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 MED12Q93074 2177 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 A8MUA0 341 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 YY2O15391 372 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ASLP04424 464 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 HSD17B1P14061 328 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CCNA2P20248 432 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SEPHS1P49903 392 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 GSTM4Q03013 218 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PMS2P3Q13401 168 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 RAPSNQ13702 412 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CYBRD1Q53TN4 286 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ZNF385BQ569K4 471 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ADCK1Q86TW2 530 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 AADATQ8N5Z0 425 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 RORBQ92753 470 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 REPS1Q96D71 796 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 PDXPQ96GD0 296 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 FAM129BQ96TA1 746 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 NTMT1Q9BV86 223 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 GPR174Q9BXC1 333 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CEP44Q9C0F1 390 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SFXN1Q9H9B4 322 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TMCC3Q9ULS5 477 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa7.2□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 AREL1O15033 823 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CBSLP0DN79 551 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 GGT1P19440 569 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 KELP23276 732 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 HTR1BP28222 390 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.269e-7■■□□□ 14.5
PKP4-217ENST00000628904 CBSP35520 551 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 CDK6Q00534 326 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 MXD1Q05195 221 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ITGADQ13349 1161 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 VMACQ2NL98 169 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 LCN8Q6JVE9 175 aa7.19□□□□□ -1.26
PKP4-217ENST00000628904 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.19□□□□□ -1.26
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