RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620944.4

NME4-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-211ENST00000620944 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.878e-17■■■■■ 69.3
NME4-211ENST00000620944 EHD1Q9H4M9 534 aa20.48■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 KLHL31Q9H511 634 aa20.48■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 PLA2G3Q9NZ20 509 aa20.48■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 NUDT4Q9NZJ9 180 aa20.48■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 ACOT9Q9Y305 439 aa20.48■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 A0A088AWK7 358 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 RNH1P13489 461 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 OR4D2P58180 307 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 BMPR2Q13873 1038 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 PLPP5Q8NEB5 264 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 SUN3Q8TAQ9 357 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 PRR7Q8TB68 274 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 CREB3L4Q8TEY5 395 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 TSLPQ969D9 159 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 GAL3ST3Q96A11 431 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 LPAR4Q99677 370 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 LANCL2Q9NS86 450 aa20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 A0A087X1B8 175 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 TRAV17A0A0B4J275 112 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 PRMT3O60678 531 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 KERAO60938 352 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 MYBL2P10244 700 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 GMPRP36959 345 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 BTN3A2P78410 334 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 IRF8Q02556 426 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 HYAL2Q12891 473 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 FAM83EQ2M2I3 478 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 FAM180AQ6UWF9 173 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 CYP4X1Q8N118 509 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 PTCHD1Q96NR3 888 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 EFCAB11Q9BUY7 163 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 CD244Q9BZW8 370 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 NT5DC2Q9H857 520 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 KCNK13Q9HB14 408 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 STMN3Q9NZ72 180 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 ABI3Q9P2A4 366 aa20.46■□□□□ 0.87
NME4-211ENST00000620944 CLEC18AA5D8T8 446 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 ANKUB1A6NFN9 424 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 SYCE1LA8MT33 242 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 ERI3O43414 337 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 DNAJB6O75190 326 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 F10P00742 488 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 LAPTM5Q13571 262 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 KLC3Q6P597 504 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 CLEC18BQ6UXF7 455 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 ISCA2Q86U28 154 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 CLEC18CQ8NCF0 446 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 HAS2Q92819 552 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 FMO2Q99518 471 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 OPTCQ9UBM4 332 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.45■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 RELNP78509 3460 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 A0A0G2JN53 185 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 LRIT2A6NDA9 550 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 UBXN8O00124 270 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 CLEC3AO75596 197 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 ACSL3O95573 720 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 WDPCPO95876 746 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 SERPINB8P50452 374 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 TNFSF10P50591 281 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 TAS2R50P59544 299 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.863e-6■□□□□ 9.3
NME4-211ENST00000620944 TGM3Q08188 693 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 DLG1Q12959 904 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 CHIT1Q13231 466 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 DOC2AQ14183 400 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 KIF18AQ8NI77 898 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 M1APQ8TC57 530 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 GRHL3Q8TE85 626 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 NXNL1Q96CM4 212 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 ZNF354BQ96LW1 612 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 SNX15Q9NRS6 342 aa20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NME4-211ENST00000620944 NTNG1Q9Y2I2 539 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms