RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620854.4

NEDD9-216, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NEDD9, Length 4,086 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9-216ENST00000620854 GPR17Q13304 367 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 IL18R1Q13478 541 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 LRRC73Q5JTD7 316 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MACC1Q6ZN28 852 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DEF8Q6ZN54 512 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 LAX1Q8IWV1 398 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.71□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 KATNBL1Q9H079 304 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 AHSPQ9NZD4 102 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.71□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MEIOCA2RUB1 952 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.7□□□□□ -1.34
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NEDD9-216ENST00000620854 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CLDN11O75508 207 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 FGF19O95750 216 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 HTR2BP41595 481 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 UGT2B15P54855 530 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ACVR1Q04771 509 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ABHD18Q0P651 414 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 VMACQ2NL98 169 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PYDC2Q56P42 97 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 Q5BKY6 102 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ATG9BQ674R7 924 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 GALNT7Q86SF2 657 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CDH24Q86UP0 819 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NLRP8Q86W28 1048 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 LACC1Q8IV20 430 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DTX3Q8N9I9 347 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 KCNJ9Q92806 393 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 KAT2AQ92830 837 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ART5Q96L15 291 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 C1orf74Q96LT6 269 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 YIPF1Q9Y548 306 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 FAM172BPA6NC97 362 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 CLCA1A8K7I4 914 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 LRRTM2O43300 516 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MTX2O75431 263 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SEMA3DO95025 777 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 KCNK5O95279 499 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SOX14O95416 240 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TACR2P21452 398 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 RPIAP49247 311 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 KEAP1Q14145 624 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NFE2L1Q14494 772 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NADSYN1Q6IA69 706 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 USP45Q70EL2 814 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 MTSS1LQ765P7 747 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TEX26Q8N6G2 289 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 B3GNT7Q8NFL0 401 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NELL1Q92832 810 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ZNF566Q969W8 418 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 EID2BQ96D98 161 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NLNQ9BYT8 704 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DHRS7Q9Y394 339 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TSC2P49815 1807 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 A0A1W2PQ09 198 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 K7ERQ8 282 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TNFRSF10AO00220 468 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SLC28A1O00337 649 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 ACSL4O60488 711 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 NR2F1P10589 423 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SDC1P18827 310 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 TNNI3P19429 210 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 SLC6A4P31645 630 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 PTPN5P54829 565 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 DSC3Q14574 896 aa6.7□□□□□ -1.34
NEDD9-216ENST00000620854 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.7□□□□□ -1.34
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