RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 PIK3CGP48736 1102 aa11.01□□□□□ -0.65
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CAPNS1-209ENST00000590049 ST14Q9Y5Y6 855 aa11□□□□□ -0.65
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CAPNS1-209ENST00000590049 SLC19A1P41440 591 aa10.99□□□□□ -0.65
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CAPNS1-209ENST00000590049 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.653e-9■□□□□ 10.3
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF678Q5SXM1 525 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
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CAPNS1-209ENST00000590049 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 PLXDC1Q8IUK5 500 aa10.99□□□□□ -0.65
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CAPNS1-209ENST00000590049 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SNX31Q8N9S9 440 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 OR52E1Q8NGJ3 308 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC37A2Q8TED4 501 aa10.99□□□□□ -0.65
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