RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 OSBPL10Q9BXB5 764 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 USP22Q9UPT9 525 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 CHD6Q8TD26 2715 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM149AA5PLN7 773 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 EVPLLA8MZ36 301 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 YKT6O15498 198 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf105O95561 183 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 ADRB3P13945 408 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 PPIBP23284 216 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 ALDH3B2P48448 385 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 ALDH3A2P51648 485 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 NEK2P51955 445 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 RPA4Q13156 261 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 BIRC2Q13490 618 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 GK3PQ14409 553 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 INAVAQ3KP66 663 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 UNC5DQ6UXZ4 953 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 USP51Q70EK9 711 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM145Q8NBT3 493 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 TSSK3Q96PN8 268 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 SEPHS2Q99611 448 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 DYRK4Q9NR20 520 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 USE1Q9NZ43 259 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 PPT2Q9UMR5 302 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 FREM2Q5SZK8 3169 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A087WXM4 84 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL33A6NCF5 533 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM202A6NGA9 273 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 RFXANKO14593 260 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 EI24O14681 340 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 CD22P20273 847 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTT1P30711 240 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 ACSM2AQ08AH3 577 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 LAPTM5Q13571 262 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 DAG1Q14118 895 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 PAGE2BQ5JRK9 111 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 ACSM2BQ68CK6 577 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 GALNT18Q6P9A2 607 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 SATL1Q86VE3 508 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM162AQ96A26 154 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 PHF12Q96QT6 1004 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 SGPP1Q9BX95 441 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 NTN4Q9HB63 628 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 BTNL2Q9UIR0 455 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHGB4Q9UN71 923 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-204ENST00000587718 UPK1AO00322 258 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 CREG1O75629 220 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 PGM3O95394 542 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 TACR1P25103 407 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 GPR1P46091 355 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 BNIP3Q12983 259 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ANXA8L1Q5VT79 327 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM47BQ8NA70 645 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 FIG4Q92562 907 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 SDCCAG3Q96C92 435 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 IKZF5Q9H5V7 419 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 FTSJ1Q9UET6 329 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 CORO2BQ9UQ03 480 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 CA5BQ9Y2D0 317 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 FADS3Q9Y5Q0 445 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PQU0 124 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 E7EQ34 232 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 PDLIM1O00151 329 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC16A8O95907 504 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 C6P13671 934 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 NADK2Q4G0N4 442 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 MED27Q6P2C8 311 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 HORMAD1Q86X24 394 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 OXR1Q8N573 874 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 OR9A1PQ8NGU1 263 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2L2Q8NH16 312 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 CHTF18Q8WVB6 975 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 UBE2E3Q969T4 207 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC47A1Q96FL8 570 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 VPS50Q96JG6 964 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 OR4K3Q96R72 315 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 PTTG2Q9NZH5 202 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 DYRK1BQ9Y463 629 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPRBP23467 1997 aa24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms