RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 HERC3Q15034 1050 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 ABHD13Q7L211 337 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 TMEM151BQ8IW70 566 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 SPACA3Q8IXA5 215 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 CMTM7Q96FZ5 175 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 HBEGFQ99075 208 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 DPH1Q9BZG8 443 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 IL17BQ9UHF5 180 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 SNX6Q9UNH7 406 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 SCN3AQ9NY46 2000 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 SAP18O00422 153 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 ATP8B1O43520 1251 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 ITM2AO43736 263 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 LIFP15018 202 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 HMOX2P30519 316 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 DLSTP36957 453 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 PLA2G16P53816 162 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 FOXL2P58012 376 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 SYT16Q17RD7 645 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 ARHGAP40Q5TG30 622 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 OR2L5Q8NG80 312 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 COL26A1Q96A83 441 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 CDC14AQ9UNH5 594 aa29.77■■■□□ 2.36
GIPC1-205ENST00000586027 URADA6NGE7 173 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 DYNC1I1O14576 645 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 RDH16O75452 317 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 WT1P19544 449 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 SERPINB3P29508 390 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 DNASE1L3Q13609 305 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 DSG2Q14126 1118 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 DEPDC1Q5TB30 811 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 FAM69BQ5VUD6 431 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 CLEC6AQ6EIG7 209 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 ABHD17CQ6PCB6 329 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 SELENOMQ8WWX9 145 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 QRFPRQ96P65 431 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 C17orf62Q9BQA9 187 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 C20orf27Q9GZN8 174 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 CTSFQ9UBX1 484 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 SSUH2Q9Y2M2 353 aa29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 FBLP22087 321 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 SERPINB5P36952 375 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 AVPR1BP47901 424 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 PPP2R2AP63151 447 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 BTN3A2P78410 334 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 PHEXP78562 749 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 NCF4Q15080 339 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 MLIPQ5VWP3 458 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 OR5T3Q8NGG3 340 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 PPT2Q9UMR5 302 aa29.75■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 TMEM233B4DJY2 109 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 H0YIG0 161 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 H3BQF6 201 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 RTCAO00442 366 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 KRT6AP02538 564 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 KRT6BP04259 564 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 NEFHP12036 1026 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 KRT6CP48668 564 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 RPS18P62269 152 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 OLR1P78380 273 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 ABRAXAS2Q15018 415 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 SCIMPQ6UWF3 145 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 CHSY3Q70JA7 882 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 OVCH1Q7RTY7 1134 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 PRDM7Q9NQW5 492 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 PSD3Q9NYI0 1048 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 HCN3Q9P1Z3 774 aa29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 C21orf140B9A014 251 aa29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 C9J4A7 227 aa29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 RRP8O43159 456 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 EFSO43281 561 aa29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 CHN1P15882 459 aa29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 ITPKBP27987 946 aa29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 TMEM35AQ53FP2 167 aa29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 TRIM40Q6P9F5 258 aa29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 ZNF793Q6ZN11 406 aa29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa29.73■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 TMEM114B3SHH9 223 aa29.72■■■□□ 2.35
GIPC1-205ENST00000586027 AZIN1O14977 448 aa29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms