RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569341.1

CFDP1-208, Transcript of craniofacial development protein 1, human

TSL 3

Gene CFDP1, Length 454 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFDP1-208	ENST00000569341	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF786	Q8N393	782 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SVOPL	Q8N434	492 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	RNF148	Q8N7C7	305 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SNX31	Q8N9S9	440 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	IPMK	Q8NFU5	416 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	PCED1B	Q96HM7	432 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CCDC115	Q96NT0	180 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	NELL2	Q99435	816 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	DERL2	Q9GZP9	239 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	AIG1	Q9NVV5	245 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	PSME2	Q9UL46	239 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	NEU3	Q9UQ49	428 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341		A6NCN8	305 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341		H3BMQ9	156 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341		I6L893	689 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341		M0QZ92	97 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	FXYD1	O00168	92 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	NME4	O00746	187 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	DLGAP1	O14490	977 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SOCS2	O14508	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	PTGES	O14684	152 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	ARPC2	O15144	300 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	IDH3B	O43837	385 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	KCNJ13	O60928	360 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	TIPRL	O75663	272 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SLC22A3	O75751	556 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CLPX	O76031	633 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	BEST1	O76090	585 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CDK14	O94921	469 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SCEL	O95171	688 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CSPG5	O95196	566 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	OLFM2	O95897	454 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	UROS	P10746	265 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	HGF	P14210	728 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CD1D	P15813	335 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	TYMP	P19971	482 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	AKAP5	P24588	427 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CD6	P30203	668 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	HOXC8	P31273	242 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	AVPR1A	P37288	418 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CCR10	P46092	362 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	SERPINB10	P48595	397 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CPT1A	P50416	773 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CLCN4	P51793	760 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	B2M	P61769	119 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	ERVK-8	P63133	956 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CFDP1-208	ENST00000569341	CSNK2B	P67870	215 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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