RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 PAOXQ6QHF9 649 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ABHD13Q7L211 337 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 KCT2Q8NC54 265 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 CMTM5Q96DZ9 223 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ZBTB18Q99592 522 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 TBCDQ9BTW9 1192 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 DPY30Q9C005 99 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM45AQ9NWC5 275 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC167Q9P0B6 97 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 PDP2Q9P2J9 529 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.74■■□□□ 1.23
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MEIS3-204ENST00000558555 CBFA2T3O75081 653 aa22.73■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 BSGP35613 385 aa22.73■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ASMTP46597 345 aa22.73■■□□□ 1.23
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MEIS3-204ENST00000558555 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa22.73■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ABHD17CQ6PCB6 329 aa22.73■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa22.73■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 D2HGDHQ8N465 521 aa22.73■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 TSSK3Q96PN8 268 aa22.73■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 AICDAQ9GZX7 198 aa22.73■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ARL8BQ9NVJ2 186 aa22.73■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa22.72■■□□□ 1.23
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MEIS3-204ENST00000558555 PRDX6P30041 224 aa22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 TSFMP43897 325 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 UFM1P61960 85 aa22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF763Q0D2J5 394 aa22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 PTGR1Q14914 329 aa22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 HKDC1Q2TB90 917 aa22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 STPG1Q5TH74 334 aa22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 UBE3DQ7Z6J8 389 aa22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 CDC26Q8NHZ8 85 aa22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 NSL1Q96IY1 281 aa22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC74BQ96LY2 380 aa22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ROGDIQ9GZN7 287 aa22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 A0A088AWK7 358 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 HCRTR1O43613 425 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 GBAP04062 536 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 JAK1P23458 1154 aa22.71■■□□□ 1.23
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MEIS3-204ENST00000558555 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa22.71■■□□□ 1.23
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MEIS3-204ENST00000558555 CLHC1Q8NHS4 586 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa22.71■■□□□ 1.23
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MEIS3-204ENST00000558555 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 A0A0G2JN53 185 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 EEDO75530 441 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 COX4I1P13073 169 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 TACR1P25103 407 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 MAPK12P53778 367 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 CLDN8P56748 225 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 RAB8AP61006 207 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 PHF19Q5T6S3 580 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 FANCEQ9HB96 536 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 LHX9Q9NQ69 397 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-204ENST00000558555 DCDC2BA2VCK2 349 aa22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD28O15084 1053 aa22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 CBX6O95503 412 aa22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 ILKQ13418 452 aa22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 GK5Q6ZS86 529 aa22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 SNX32Q86XE0 403 aa22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 PROKR1Q8TCW9 393 aa22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 NETO1Q8TDF5 533 aa22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 STARD8Q92502 1023 aa22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF285Q96NJ3 590 aa22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 STARD5Q9NSY2 213 aa22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 TXLNGQ9NUQ3 528 aa22.7■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 LOC100653049A0A140TA62 436 aa22.69■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 FAM234BA2RU67 622 aa22.69■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM150CB9EJG8 249 aa22.69■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 NR5A2O00482 541 aa22.69■■□□□ 1.22
MEIS3-204ENST00000558555 PRMT3O60678 531 aa22.69■■□□□ 1.22
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