RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543882.5

TM7SF3-215, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 5

Gene TM7SF3, Length 762 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-215ENST00000543882 PEX12O00623 359 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 CLGNO14967 610 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 SUV39H1O43463 412 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 KLK8O60259 260 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 SH3BGRLO75368 114 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 KRT38O76015 456 aa7.4□□□□□ -1.22
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TM7SF3-215ENST00000543882 TUBB8Q3ZCM7 444 aa7.4□□□□□ -1.22
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TM7SF3-215ENST00000543882 NADK2Q4G0N4 442 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
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TM7SF3-215ENST00000543882 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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TM7SF3-215ENST00000543882 CCT6BQ92526 530 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 TSLPQ969D9 159 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 WDR34Q96EX3 536 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 SMIM10Q96HG1 83 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 SCYL1Q96KG9 808 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 EPN3Q9H201 632 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
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TM7SF3-215ENST00000543882 ZNF160Q9HCG1 818 aa7.4□□□□□ -1.22
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TM7SF3-215ENST00000543882 COPG2Q9UBF2 871 aa7.4□□□□□ -1.22
TM7SF3-215ENST00000543882 OPTCQ9UBM4 332 aa7.4□□□□□ -1.22
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TM7SF3-215ENST00000543882 ERI3O43414 337 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 CHST10O43529 356 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 SERPINA6P08185 405 aa7.39□□□□□ -1.23
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TM7SF3-215ENST00000543882 CNTFP26441 200 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 CERS1P27544 350 aa7.39□□□□□ -1.23
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TM7SF3-215ENST00000543882 E2F2Q14209 437 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 MYBPC3Q14896 1274 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 HERC3Q15034 1050 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 PCOLCEQ15113 449 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 KLC3Q6P597 504 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 TMEM205Q6UW68 189 aa7.39□□□□□ -1.23
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TM7SF3-215ENST00000543882 CA13Q8N1Q1 262 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.39□□□□□ -1.23
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TM7SF3-215ENST00000543882 CLEC1AQ8NC01 280 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.39□□□□□ -1.23
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TM7SF3-215ENST00000543882 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 PHF21BQ96EK2 531 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 IP6K3Q96PC2 410 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 RHBGQ9H310 441 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 EHD1Q9H4M9 534 aa7.39□□□□□ -1.23
TM7SF3-215ENST00000543882 NT5DC2Q9H857 520 aa7.39□□□□□ -1.23
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