RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 XCR1P46094 333 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CSNK1DP48730 415 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CRISP1P54107 249 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 GPR17Q13304 367 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 PTPRRQ15256 657 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CHRNA6Q15825 494 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CDKN3Q16667 212 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 FAM26DQ5JW98 314 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CCNJQ5T5M9 372 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CPTPQ5TA50 214 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 HSDL2Q6YN16 418 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 OR52N2Q8NGI0 321 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 WDR20Q8TBZ3 569 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 GPR152Q8TDT2 470 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 SH3KBP1Q96B97 665 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 MND1Q9BWT6 205 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 EBPLQ9BY08 206 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 BARHL1Q9BZE3 327 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 MCOLN1Q9GZU1 580 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 PRDM8Q9NQV8 689 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 RLIMQ9NVW2 624 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 NDUFB11Q9NX14 153 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 MUTYHQ9UIF7 546 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 KLHL20Q9Y2M5 609 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 DSPPQ9NZW4 1301 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 B4DXG7 233 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 RGS5O15539 181 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 ARHGEF9O43307 516 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 B4GALT3O60512 393 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 TSPAN3O60637 253 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 NBNO60934 754 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 TNFRSF21O75509 655 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 C1QCP02747 245 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 ALPIP09923 528 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 NUDT7P0C024 238 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 BPIP17213 487 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 MYL9P24844 172 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 PKLRP30613 574 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 NUDT1P36639 197 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CRISP3P54108 245 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CYP4F2P78329 520 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 ACSM2AQ08AH3 577 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CHIT1Q13231 466 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 SLAMF1Q13291 335 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 BAK1Q16611 211 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 PTCHD3Q3KNS1 767 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CCDC58Q4VC31 144 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CRB2Q5IJ48 1285 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 SNAP47Q5SQN1 464 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 ACSM2BQ68CK6 577 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 SIGIRRQ6IA17 410 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 TPGS1Q6ZTW0 290 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 PTCHD4Q6ZW05 846 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 ZNF767PQ75MW2 155 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 DENND1CQ8IV53 801 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 RASGRP3Q8IV61 690 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 ASB11Q8WXH4 323 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 KLHL6Q8WZ60 621 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 TMEM80Q96HE8 168 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 DMRTB1Q96MA1 342 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 FRMD6Q96NE9 622 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 SAMD11Q96NU1 681 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 FAM129BQ96TA1 746 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 MED18Q9BUE0 208 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CNPPD1Q9BV87 410 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 RNF121Q9H920 327 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 ATP6V1HQ9UI12 483 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 SSR3Q9UNL2 185 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 ENPP4Q9Y6X5 453 aa10.13□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 FADS2P1A8MWK0 482 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 H0YIV9 168 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 GFYI3L273 518 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 KPNA5O15131 536 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 YY2O15391 372 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 PROM1O43490 865 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 HCN1O60741 890 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 LATS1O95835 1130 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 ADAP00813 363 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 OR56A5P0C7T3 313 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 RHCEP18577 417 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 IDSP22304 550 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CPN2P22792 545 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 THPOP40225 353 aa10.12□□□□□ -0.79
CS-202ENST00000542324 CRYBB2P43320 205 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms