RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 RNF212Q495C1 297 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 SLC22A10Q63ZE4 541 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 MILR1Q7Z6M3 343 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CMC1Q7Z7K0 106 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 LSMEM2Q8N112 164 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PQY0 241 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 CALML5Q9NZT1 146 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 A0A1W2PQH9 124 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 SOBPA7XYQ1 873 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 FPGTO14772 594 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 FKTNO75072 461 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 SCD5Q86SK9 330 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRD-214ENST00000540109 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 MUS81Q96NY9 551 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 NPWQ8N729 165 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRD-214ENST00000540109 RBCK1Q9BYM8 510 aa5.85□□□□□ -1.47
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