RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539498.1

RAN-209, Transcript of RAN, member RAS oncogene family, human

TSL 2

Gene RAN, Length 1,659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAN-209	ENST00000539498	ASPG	Q86U10	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PIGT	Q969N2	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	DHX58	Q96C10	678 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CARD9	Q9H257	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498		H3BQV1	296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	RAMP2	O60895	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CCNE2	O96020	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	LDLR	P01130	860 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ASGR1	P07306	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SYT1	P21579	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CBL	P22681	906 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MMP15	P51511	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ABAT	P80404	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PDE1B	Q01064	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	GPS2	Q13227	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PTGR1	Q14914	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	KLC3	Q6P597	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	P2RX5	Q93086	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	AURKC	Q9UQB9	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498		A0A087WWV3	80 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MID1	O15344	667 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MSH4	O15457	936 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CHMP2A	O43633	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	UGT1A6	P19224	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CERS1	P27544	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	NPBWR1	P48145	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ACLY	P53396	1101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	BNC1	Q01954	994 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	DSC1	Q08554	894 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	DMPK	Q09013	629 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RAN-209	ENST00000539498	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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