RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	SPDL1	Q96EA4	605 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	FCRL1	Q96LA6	429 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	OR2M4	Q96R27	311 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PELI2	Q9HAT8	420 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131		B4DGG1	531 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131		E7ENX8	843 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	STMND1	H3BQB6	276 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	NR5A2	O00482	541 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	FBP2	O00757	339 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	FFAR3	O14843	346 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	GPR42	O15529	346 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	CPNE6	O95741	557 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PDYN	P01213	254 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	TNF	P01375	233 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	CCL4	P13236	92 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SLC2A4	P14672	509 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	CXCR2	P25025	360 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	DIO3	P55073	304 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	C21orf58	P58505	322 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PSME3	P61289	254 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	RPL38	P63173	70 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	TAP2	Q03519	686 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	DOC2A	Q14183	400 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PIGG	Q5H8A4	983 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PHF19	Q5T6S3	580 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	IL23R	Q5VWK5	629 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	MED27	Q6P2C8	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SMPDL3A	Q92484	453 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	NKD1	Q969G9	470 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PYCR2	Q96C36	320 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	OR4K3	Q96R72	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	ACPT	Q9BZG2	426 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	NT5DC2	Q9H857	520 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PRSS38	A1L453	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	ANKRD28	O15084	1053 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	B4GAT1	O43505	415 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	DNAJA2	O60884	412 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SEC22B	O75396	215 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	MYO1D	O94832	1006 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	NTRK1	P04629	796 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	IL6	P05231	212 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	GP1BB	P13224	206 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	ACP5	P13686	325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	NPPB	P16860	134 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	ME2	P23368	584 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	GCK	P35557	465 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PIK3CB	P42338	1070 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	POLE2	P56282	527 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	CLDN8	P56748	225 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	FOXK1	P85037	733 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	KCNAB2	Q13303	367 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	BORA	Q6PGQ7	559 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	LAS2	Q8IYD9	372 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	KRT78	Q8N1N4	520 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MEG3-223	ENST00000524131	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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