RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 NME2P1O60361 137 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 LMX1BO60663 402 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CXCL14O95715 111 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 FGF19O95750 216 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 GAS8O95995 478 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 NGFP01138 241 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 MT-ND2P03891 347 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 ALPPP05187 535 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 APRTP07741 180 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 HMOX1P09601 288 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 ALPPL2P10696 532 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 GAP43P17677 238 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 ACP1P24666 158 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 ALDH1B1P30837 517 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 ASMTP46597 345 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 NUMBP49757 651 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 LUMP51884 338 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CSNK2BP67870 215 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 IRX4P78413 519 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 IL1RL1Q01638 556 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 DRP2Q13474 957 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 SQLEQ14534 574 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 DUSP5Q16690 384 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM106AQ4KMX7 169 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM76BQ5HYJ3 339 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 SH2D5Q6ZV89 423 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CROCCP3Q8IVE0 287 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC22A15Q8IZD6 547 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 BATF2Q8N1L9 274 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 TEX9Q8N6V9 391 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 EXOC6Q8TAG9 804 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 GOLGA5Q8TBA6 731 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 URGCPQ8TCY9 931 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CD99L2Q8TCZ2 262 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAPK15Q8TD08 544 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 SEPT8Q92599 483 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 HAS2Q92819 552 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 NXPE2Q96DL1 559 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 OMA1Q96E52 524 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 DUX3Q96PT4 197 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 F2RL3Q96RI0 385 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 PCDHB18PQ96TA0 734 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 EPYCQ99645 322 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 SSX3Q99909 188 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 ASCL2Q99929 193 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC39A8Q9C0K1 460 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 HOXD1Q9GZZ0 328 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 ATG10Q9H0Y0 220 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 ABCG8Q9H221 673 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 PIGVQ9NUD9 493 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 HACD3Q9P035 362 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 FGD5Q6ZNL6 1462 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 A0A087WZ39 114 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCDC69A6NI79 296 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 C15orf61A6NNL5 157 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 SNURFLB1AK76 121 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF732B4DXR9 585 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 C19orf81C9J6K1 198 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 E5RGE8 158 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 H3BMM5 538 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 P2RX6O15547 441 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 EPOP01588 193 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 SFTPBP07988 381 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 GSTA2P09210 222 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 SBK2P0C263 348 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CEACAM1P13688 526 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 AREGP15514 252 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 GNB3P16520 340 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 ITGB6P18564 788 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 PTMSP20962 102 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CTNNA2P26232 953 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 STIP1P31948 543 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 SLC1A3P43003 542 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 TNFSF10P50591 281 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CNN1P51911 297 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 HUNKP57058 714 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCZ1BP86790 482 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CYCSP99999 105 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 HSPA14Q0VDF9 509 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 WASHC5Q12768 1159 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-390P-201ENST00000516259 CEACAM7Q14002 265 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.9 ms