RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 FRMD7Q6ZUT3 714 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR155Q7Z3F1 870 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 VN1R5Q7Z5H4 357 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB43Q86YS6 212 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 C10orf107Q8IVU9 208 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 AMER3Q8N944 861 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 THAP4Q8WY91 577 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 MIEF2Q96C03 454 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 VPS50Q96JG6 964 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNC2Q96PR1 638 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 FRG2BQ96QU4 278 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 MS4A8Q9BY19 250 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 GSTO2Q9H4Y5 243 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ELOVL6Q9H5J4 265 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 PRORYQ9H606 182 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC17A7Q9P2U7 560 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 PKD1L2Q7Z442 2459 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ERI3O43414 337 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SERPINB5P36952 375 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 CDC20Q12834 499 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 DEFB134Q4QY38 66 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR20Q8TBZ3 569 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 CNDP1Q96KN2 507 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 CDK15Q96Q40 435 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 YIPF2Q9BWQ6 316 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 DMRT3Q9NQL9 472 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ESRRBO95718 433 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT6AP02538 564 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT6BP04259 564 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ZGLP1P0C6A0 271 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 CREB1P16220 341 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 WT1P19544 449 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT6CP48668 564 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC18A1P54219 525 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 CUL3Q13618 768 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 AGBL2Q5U5Z8 902 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 STT3BQ8TCJ2 826 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 OR1F2PQ96R84 312 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SERPINI1Q99574 410 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 TBCDQ9BTW9 1192 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNK9Q9NPC2 374 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SEMA3GQ9NS98 782 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 NMRK1Q9NWW6 199 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 CTSFQ9UBX1 484 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ZFHX4Q86UP3 3567 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SGK494L7N484 410 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ETV4P43268 484 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB8AP61006 207 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 RCN2Q14257 317 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 COL28A1Q2UY09 1125 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 DEPDC1Q5TB30 811 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 LETMD1Q6P1Q0 360 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ABHD17CQ6PCB6 329 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 PDSS2Q86YH6 399 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 OR51Q1Q8NH59 317 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 RGMAQ96B86 450 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SPSB2Q99619 263 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL31Q9H511 634 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 BRF2Q9HAW0 419 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 POLHQ9Y253 713 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 SCN3AQ9NY46 2000 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 BIRC5O15392 142 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 B3GALT2O43825 422 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 NPHS1O60500 1241 aa25.39■■□□□ 1.66
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SH3BP2-212ENST00000508338 BPGMP07738 259 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 HSD3B1P14060 373 aa25.39■■□□□ 1.66
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SH3BP2-212ENST00000508338 ERV3-1Q14264 604 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 PRSS41Q7RTY9 318 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 DTWD1Q8N5C7 304 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 AGAP11Q8TF27 550 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 TLCD1Q96CP7 247 aa25.39■■□□□ 1.66
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SH3BP2-212ENST00000508338 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 MID1IP1Q9NPA3 183 aa25.39■■□□□ 1.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ZZEF1O43149 2961 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-212ENST00000508338 LAMA5O15230 3695 aa25.39■■□□□ 1.65
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGEB17A8MXT2 336 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-212ENST00000508338 NKX2-8O15522 239 aa25.38■■□□□ 1.65
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