RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR2T29Q8NH02 315 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAL2Q969L2 176 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ALG14Q96F25 216 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TPD52L3Q96J77 140 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TTPALQ9BTX7 342 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HDAC8Q9BY41 377 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DUSP21Q9H596 190 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CD84Q9UIB8 345 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.34□□□□□ -1.39
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TET1Q8NFU7 2136 aa6.34□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TTC34A8MYJ7 566 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C9orf172C9J069 976 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 M0R129 80 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLIC1O00299 241 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FPGTO14772 594 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM20BO75063 409 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WDR47O94967 919 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNK5O95279 499 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRBC1P01850 177 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC159P0C7I6 412 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COL6A1P12109 1028 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ITGALP20701 1170 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TGM1P22735 817 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CRYBA2P53672 197 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WNT3P56703 355 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC13A2Q13183 592 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TXNDC8Q6A555 127 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UTS2BQ765I0 119 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHST9Q7L1S5 443 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADCK1Q86TW2 530 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTOV1Q86YD1 416 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NXPE1Q8N323 547 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 APH1BQ8WW43 257 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PROX1Q92786 737 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DNASE1L2Q92874 299 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCNC2Q96PR1 638 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SH3GL1Q99961 368 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ELOVL6Q9H5J4 265 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PALMDQ9NP74 551 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL1RAPQ9NPH3 570 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 M0QX08 132 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AQP7O14520 342 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WNT9AO14904 365 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AQP9O43315 295 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NTRK1P04629 796 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ITGAMP11215 1152 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LAMP1P11279 417 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CD36P16671 472 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AMD1P17707 334 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CD22P20273 847 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GRK5P34947 590 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TGFBR2P37173 567 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LIPAP38571 399 aa6.33□□□□□ -1.4
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAGEA2P43356 314 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms