RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 MAPRE3Q9UPY8 281 aa12.3□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 IGLV3-27P01718 113 aa12.3□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 C17orf62Q9BQA9 187 aa12.3□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP12.3□□□□□ -0.444e-7■□□□□ 10.7
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RABGEF1-211ENST00000503687 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF730Q6ZMV8 503 aa12.3□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 P2RY12Q9H244 342 aa12.3□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 GSAPA4D1B5 854 aa12.29□□□□□ -0.44
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RABGEF1-211ENST00000503687 MFSD4BQ5TF39 518 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 C7orf61Q8IZ16 206 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 NCSTNQ92542 709 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 TUBA1CQ9BQE3 449 aa12.29□□□□□ -0.44
RABGEF1-211ENST00000503687 ACTL8Q9H568 366 aa12.29□□□□□ -0.44
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