RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502492.5

SNF8-202, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNF8, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8-202ENST00000502492 REEP4Q9H6H4 257 aa22.11■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.11■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 KCNE2Q9Y6J6 123 aa22.11■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 AIREO43918 545 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 LEFTY1O75610 366 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 CDK1P06493 297 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 ETFAP13804 333 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 TIMP2P16035 220 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 MAGEA8P43361 318 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 MAPK9P45984 424 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 TEKQ02763 1124 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 IFI44LQ53G44 452 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 SAMD11Q96NU1 681 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 VPS35Q96QK1 796 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 MMP27Q9H306 513 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 RLIMQ9NVW2 624 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 SPASTQ9UBP0 616 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.1■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 TSPAN11A1L157 253 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 OPN1SWP03999 348 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 CD40LGP29965 261 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 GSSP48637 474 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 CLK1P49759 484 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 PNLIPRP1P54315 467 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 RBBP4Q09028 425 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 OR4K1Q8NGD4 311 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 OR52N2Q8NGI0 321 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 THSD1Q9NS62 852 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 PTPRSQ13332 1948 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 PRAMEF25A6NGN4 478 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 A8MVJ9 347 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 GABRB1P18505 474 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 TNFRSF1BP20333 461 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 CD300CQ08708 224 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 ZNF763Q0D2J5 394 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 DNASE1L3Q13609 305 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 TIGD6Q17RP2 521 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 MICAQ29983 383 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 INAVAQ3KP66 663 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 GPR65Q8IYL9 337 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 MYLIPQ8WY64 445 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 GLYATL1Q969I3 302 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 REPS1Q96D71 796 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 RAD9AQ99638 391 aa22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 CTSKP43235 329 aa22.08■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 ZNF284Q2VY69 593 aa22.08■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 ZNF404Q494X3 552 aa22.08■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 GCNT6Q5T4J0 391 aa22.08■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 CCDC80Q76M96 950 aa22.08■■□□□ 1.13
SNF8-202ENST00000502492 SLC35A5Q9BS91 424 aa22.08■■□□□ 1.13
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SNF8-202ENST00000502492 DMC1Q14565 340 aa22.08■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 ARSIQ5FYB1 569 aa22.08■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 TMEM215Q68D42 235 aa22.08■■□□□ 1.12
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SNF8-202ENST00000502492 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa22.08■■□□□ 1.12
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SNF8-202ENST00000502492 WDR34Q96EX3 536 aa22.08■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 FOPNLQ96NB1 174 aa22.08■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa22.08■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 TMEM38AQ9H6F2 299 aa22.08■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 AMBNQ9NP70 447 aa22.08■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.08■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 ZNF226Q9NYT6 803 aa22.08■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 INSL6Q9Y581 213 aa22.08■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 A3GALT2U3KPV4 340 aa22.08■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 PCM1Q15154 2024 aa22.07■■□□□ 1.12
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SNF8-202ENST00000502492 OR1E2P47887 323 aa22.07■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 CASP9P55211 416 aa22.07■■□□□ 1.12
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SNF8-202ENST00000502492 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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SNF8-202ENST00000502492 ARMCX6Q7L4S7 300 aa22.07■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 COMMD6Q7Z4G1 85 aa22.07■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 TMPRSS11BQ86T26 416 aa22.07■■□□□ 1.12
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SNF8-202ENST00000502492 ZNF480Q8WV37 535 aa22.07■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 CORO1BQ9BR76 489 aa22.07■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 C6orf47O95873 294 aa22.07■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 CDH12P55289 794 aa22.07■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 SPIBQ01892 262 aa22.07■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa22.07■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SNF8-202ENST00000502492 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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