RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 Q8NA96 180 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 TTLQ8NG68 377 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 UBTD2Q8WUN7 234 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 TSLPQ969D9 159 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 MS4A6EQ96DS6 147 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 WDR34Q96EX3 536 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 EFCAB11Q9BUY7 163 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 TXLNGYQ9BZA5 131 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ZNF700Q9H0M5 742 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 EHD1Q9H4M9 534 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 NT5DC2Q9H857 520 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 C5AR2Q9P296 337 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 COPG2Q9UBF2 871 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ZNF180Q9UJW8 692 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PLAAQ9Y263 795 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 A0A1W2PQ72 361 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 LRIT2A6NDA9 550 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 URADA6NGE7 173 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ANKDD1BA6NHY2 528 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 FAM227AF5H4B4 570 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ERI3O43414 337 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 KLHL41O60662 606 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SH3BGRLO75368 114 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 CLEC3AO75596 197 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 WFS1O76024 890 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PRR35P0CG20 571 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PLA2G16P53816 162 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SKP1P63208 163 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 BTN3A2P78410 334 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 RHAGQ02094 409 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ABRAXAS2Q15018 415 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SETDB1Q15047 1291 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 TBCCQ15814 346 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PAGE2BQ5JRK9 111 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ANKRD37Q7Z713 158 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 HPS6Q86YV9 775 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SIRT6Q8N6T7 355 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 TBC1D20Q96BZ9 403 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 FAR2Q96K12 515 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SCYL1Q96KG9 808 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 AGAP4Q96P64 663 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 F2RL3Q96RI0 385 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 CSAG2Q9Y5P2 127 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 HECTD1Q9ULT8 2610 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PCDH17O14917 1159 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 KLK8O60259 260 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SERPINA7P05543 415 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ITGAMP11215 1152 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PCNAP12004 261 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 RNH1P13489 461 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 EPB42P16452 691 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 CNTFP26441 200 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 CASP2P42575 452 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 BTG2P78543 158 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 FOXK1P85037 733 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 KCNC4Q03721 635 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 LAPTM5Q13571 262 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 RUNX2Q13950 521 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SLC29A2Q14542 456 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 NSDHLQ15738 373 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SFT2D3Q587I9 215 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 NIPAL1Q6NVV3 410 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 IGFL3Q6UXB1 125 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 CA13Q8N1Q1 262 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 RNF175Q8N4F7 328 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 ZADH2Q8N4Q0 377 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PLPP5Q8NEB5 264 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 CPT1CQ8TCG5 803 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PSMF1Q92530 271 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PNPLA2Q96AD5 504 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PHF21BQ96EK2 531 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 IMMP1LQ96LU5 166 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 OR1F2PQ96R84 312 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 SLAMF7Q9NQ25 335 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-214ENST00000490425 PTGFRNQ9P2B2 879 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms