RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487288.1

TAF6-215, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 6, human

TSL 5

Gene TAF6, Length 1,195 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF6-215	ENST00000487288	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	GALNT7	Q86SF2	657 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	CYP4X1	Q8N118	509 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	GPATCH11	Q8N954	259 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	AGAP11	Q8TF27	550 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	VWA7	Q9Y334	891 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288		A8MUA0	341 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	PRMT3	O60678	531 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	CLDN14	O95500	239 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	MLYCD	O95822	493 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	IVD	P26440	423 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	AHR	P35869	848 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	CYB561	P49447	251 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	ITGA8	P53708	1063 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	KRTAP10-9	P60411	292 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	REEP5	Q00765	189 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	RGS1	Q08116	209 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	CSHL1	Q14406	222 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	PPP1R7	Q15435	360 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	BBS9	Q3SYG4	887 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	ABHD13	Q7L211	337 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	GHDC	Q8N2G8	530 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	POLQ	O75417	2590 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	ABO	P16442	354 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF24	P17028	368 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	PTGER1	P34995	402 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	CA13	Q8N1Q1	262 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	SLC35F6	Q8N357	371 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	ATL1	Q8WXF7	558 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	NAT9	Q9BTE0	207 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	RHBG	Q9H310	441 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	PELI2	Q9HAT8	420 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	ZFAT	Q9P243	1243 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TAF6-215	ENST00000487288	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	CDC7	O00311	574 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	CDK2AP1	O14519	115 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	RFC3	P40938	356 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	ELK3	P41970	407 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	HLCS	P50747	726 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	SKP1	P63208	163 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF460	Q14592	562 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	ACBD4	Q8NC06	268 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	CFAP36	Q96G28	342 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	GPAM	Q9HCL2	828 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	PSAT1	Q9Y617	370 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	CACNA1C	Q13936	2221 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288		E9PLN8	166 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	SERPINA6	P08185	405 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TAF6-215	ENST00000487288	PPP2R1B	P30154	601 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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