RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483639.1

UBE2Q1-205, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-205ENST00000483639 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 ANKRD42Q8N9B4 389 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 MDS2Q8NDY4 140 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 OR5T3Q8NGG3 340 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 MCOLN3Q8TDD5 553 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 TSLPQ969D9 159 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 TM4SF19Q96DZ7 209 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 THAP11Q96EK4 314 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 SIGLEC10Q96LC7 697 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF354BQ96LW1 612 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 KCNK13Q9HB14 408 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 ANKHQ9HCJ1 492 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 KLHL1Q9NR64 748 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 TBK1Q9UHD2 729 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 TINAGQ9UJW2 476 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 COMMD10Q9Y6G5 202 aa10.71□□□□□ -0.69
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM227AF5H4B4 570 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 DNAJB6O75190 326 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 CDH16O75309 829 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 HTR1EP28566 365 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 CD96P40200 585 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 AGTR2P50052 363 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 CDKN2DP55273 166 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 ADORA2A-AS1P86434 159 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 RHAGQ02094 409 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 ABRAXAS2Q15018 415 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 OR1C1Q15619 314 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 PHKG1Q16816 387 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.76e-7■■■■□ 26.5
UBE2Q1-205ENST00000483639 BBS9Q3SYG4 887 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 SPINK14Q6IE38 97 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 EXOC3L1Q86VI1 746 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 C17orf64Q86WR6 236 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 LMNTD2Q8IXW0 634 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 NAT8LQ8N9F0 302 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 CAMKVQ8NCB2 501 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 CALML6Q8TD86 181 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 SLC13A3Q8WWT9 602 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 MOCOSQ96EN8 888 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 CHMP6Q96FZ7 201 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 PEX11GQ96HA9 241 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM167BQ9BTA0 163 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 SGPP1Q9BX95 441 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 PCBD2Q9H0N5 130 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 PARVBQ9HBI1 364 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 MMP25Q9NPA2 562 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 LANCL2Q9NS86 450 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa10.7□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 FBN2P35556 2912 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 TMEM120BA0PK00 339 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 GABRR3A8MPY1 467 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNHIT1O43257 154 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 BANF1O75531 89 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 B3GALT4O96024 378 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 C8GP07360 202 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 VIMP08670 466 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 NPPBP16860 134 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 DRD4P21917 467 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 GABRB3P28472 473 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 PGGT1BP53609 377 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 OLR1P78380 273 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 RBPJQ06330 500 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 SP140Q13342 867 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 USP10Q14694 798 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 CRYMQ14894 314 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 CDSNQ15517 529 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 NSDHLQ15738 373 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 EXT1Q16394 746 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 MEP1AQ16819 746 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 MTFR2Q6P444 385 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 PAQR3Q6TCH7 311 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 RPTNQ6XPR3 784 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 MFSD9Q8NBP5 474 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF740Q8NDX6 193 aa10.69□□□□□ -0.7
UBE2Q1-205ENST00000483639 M1APQ8TC57 530 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms