RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483538.1

POLR1A-207, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-207ENST00000483538 MLXIPLQ9NP71 852 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 DMRT3Q9NQL9 472 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 C14orf105Q9NVL8 296 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 C3orf18Q9UK00 162 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 FBXL4Q9UKA2 621 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 RNF11Q9Y3C5 154 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.41□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 H0YIV9 168 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 AGPSO00116 658 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 CHST10O43529 356 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 SMIM24O75264 130 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 GLRA3O75311 464 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 GSTA1P08263 222 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 CD63P08962 238 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 CREB1P16220 341 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 KRT4P19013 534 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 CXCR2P25025 360 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 CERS1P27544 350 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 PIK3CGP48736 1102 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 CDH13P55290 713 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 HERVK_113P63132 956 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 OCA2Q04671 838 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 SLC18A2Q05940 514 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 RUNX2Q13950 521 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 HERC3Q15034 1050 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 UNC50Q53HI1 259 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 MED27Q6P2C8 311 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM205Q6UW68 189 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 ABHD13Q7L211 337 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 C4orf33Q8N1A6 199 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 KRT78Q8N1N4 520 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 CA13Q8N1Q1 262 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 TBC1D19Q8N5T2 526 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 OR2L5Q8NG80 312 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 HUS1BQ8NHY5 278 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 PEX11GQ96HA9 241 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 F2RL3Q96RI0 385 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 CSF3RQ99062 836 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 NUDT9Q9BW91 350 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 ERVK-6Q9BXR3 956 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 ACTR8Q9H981 624 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 MKS1Q9NXB0 559 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 TMCO1Q9UM00 188 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 PLAAQ9Y263 795 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
POLR1A-207ENST00000483538 ZNF462Q96JM2 2506 aa8.4□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 TENM4Q6N022 2769 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 FAM227AF5H4B4 570 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 RTCAO00442 366 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 PLPP1O14494 284 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 PLIN3O60664 434 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 UGDHO60701 494 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 SH3BGRLO75368 114 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 SCELO95171 688 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 TGFB1P01137 390 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 CELA2AP08217 269 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 PCNAP12004 261 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 KRT15P19012 456 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 CRHR1P34998 444 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 CD97P48960 835 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 NEK2P51955 445 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 PLA2G16P53816 162 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 PRKAA2P54646 552 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 LAPTM5Q13571 262 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 PCLAFQ15004 111 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 PCOLCEQ15113 449 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1A-207ENST00000483538 RBBP7Q16576 425 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms