RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480004.1

CAPN9-204, Transcript of calpain 9, human

TSL 2

Gene CAPN9, Length 510 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPN9-204	ENST00000480004	NDST3	O95803	873 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	HLA-DQB2	P05538	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	CYC1	P08574	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	PIRT	P0C851	137 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	UGT1A6	P19224	532 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	TFEB	P19484	476 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	ACVR2A	P27037	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	UQCRC1	P31930	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	PTGER1	P34995	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	PCK1	P35558	622 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	NRG3	P56975	720 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	TAS2R50	P59544	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	CD83	Q01151	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	OGDH	Q02218	1023 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	GALNT2	Q10471	571 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	PRKG2	Q13237	762 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	GALE	Q14376	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	EXT1	Q16394	746 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	TMEM205	Q6UW68	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	LGI4	Q8N135	537 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAPN9-204	ENST00000480004		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	GABRR3	A8MPY1	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004		H3BML4	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	BCKDK	O14874	412 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	NME2P1	O60361	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	DNAJB6	O75190	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	SLC25A12	O75746	678 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	CYP7B1	O75881	506 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	NEURL1	O76050	574 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	KNG1	P01042	644 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	CELA2A	P08217	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	MMP2	P08253	660 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	ANXA5	P08758	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	MAG	P20916	626 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	CYB561	P49447	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	PRLHR	P49683	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	MGAT2	Q10469	447 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	KRT81	Q14533	505 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAPN9-204	ENST00000480004	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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