RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 DTNBP1Q96EV8 351 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 MENTQ9BUN1 341 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 EHD1Q9H4M9 534 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 FANCEQ9HB96 536 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 RPS6KA6Q9UK32 745 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1W2PPV9 198 aa8.5□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 PLPP1O14494 284 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 PPM1DO15297 605 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 APODP05090 189 aa8.5□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 IGFBP5P24593 272 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 OR1E2P47887 323 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 KCNJ10P78508 379 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 MYBPC3Q14896 1274 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SLC5A12Q1EHB4 618 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 IQCCQ4KMZ1 466 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 TTC23Q5W5X9 447 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 LCTLQ6UWM7 567 aa8.5□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 AMER3Q8N944 861 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 LINC01555Q8NAE3 123 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 STARD8Q92502 1023 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 MACROD1Q9BQ69 325 aa8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 PREBQ9HCU5 417 aa8.5□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.49□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 WASHC1A8K0Z3 465 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 K7EQS6 105 aa8.49□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 ATE1O95260 518 aa8.49□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 CDK4P11802 303 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 MATN1P21941 496 aa8.49□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 C12orf66Q96MD2 445 aa8.49□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 SUV39H1O43463 412 aa8.49□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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CDHR3-211ENST00000478080 PIK3CBP42338 1070 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 ALDH9A1P49189 494 aa8.49□□□□□ -1.05
CDHR3-211ENST00000478080 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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