RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 OOSP2Q86WS3 158 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 NUDT13Q86X67 352 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 HIPK4Q8NE63 616 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 TRPV3Q8NET8 790 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 NT5CQ8TCD5 201 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 GAB3Q8WWW8 586 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 RGMAQ96B86 450 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 MIEF2Q96C03 454 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 MTERF3Q96E29 417 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC115Q96NT0 180 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 QRFPRQ96P65 431 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
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SRPRB-202ENST00000466636 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 PCDHAC1Q9H158 963 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 KLHL31Q9H511 634 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 S100A14Q9HCY8 104 aa9.1□□□□□ -0.95
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SRPRB-202ENST00000466636 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 PILRAQ9UKJ1 303 aa9.1□□□□□ -0.95
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SRPRB-202ENST00000466636 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.1□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 EYSQ5T1H1 3165 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 A0A0A6YYD5 115 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 A0A0J9YY10 115 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1B0GTW7 788 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM221A6NGB7 291 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 LILRA5A6NI73 299 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 H3BNX3 289 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 M0R296 226 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 TMPRSS11DO60235 418 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 DNAJA2O60884 412 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 CTSVO60911 334 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 SDC3O75056 442 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 STATHP02808 62 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 SERPIND1P05546 499 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 C8BP07358 591 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 ANXA6P08133 673 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 IL3P08700 152 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 ATP6V1B2P21281 511 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 HTR1EP28566 365 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 SOX11P35716 441 aa9.09□□□□□ -0.95
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SRPRB-202ENST00000466636 TRPC1P48995 793 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 MAPK12P53778 367 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 PPP1CAP62136 330 aa9.09□□□□□ -0.95
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SRPRB-202ENST00000466636 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 KLC1Q07866 573 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 C2orf80Q0P641 193 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 SHBQ15464 509 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 TEAD4Q15561 434 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 PRSS53Q2L4Q9 553 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 MPEG1Q2M385 716 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 PLK5Q496M5 336 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 DESI1Q6ICB0 168 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 LCN8Q6JVE9 175 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF793Q6ZN11 406 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 ASPGQ86U10 573 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 C11orf74Q86VG3 221 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 CLECL1Q8IZS7 167 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM105Q8N8V8 129 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 AMER3Q8N944 861 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 OR2L5Q8NG80 312 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 SLC26A7Q8TE54 656 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 RSC1A1Q92681 617 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 TM4SF18Q96CE8 201 aa9.09□□□□□ -0.95
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SRPRB-202ENST00000466636 THAP11Q96EK4 314 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 OR2A5Q96R48 311 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 MACROD1Q9BQ69 325 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 CENPKQ9BS16 269 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 SLC6A16Q9GZN6 736 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 MUC13Q9H3R2 512 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 IKZF5Q9H5V7 419 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 HRASLS2Q9NWW9 162 aa9.09□□□□□ -0.95
SRPRB-202ENST00000466636 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
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