RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463927.6

TIMMDC1-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene TIMMDC1, Length 670 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-202ENST00000463927 STK38LQ9Y2H1 464 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-202ENST00000463927 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-202ENST00000463927 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-202ENST00000463927 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-202ENST00000463927 SPACA6W5XKT8 324 aa9.4□□□□□ -0.9
TIMMDC1-202ENST00000463927 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.4□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 ATMQ13315 3056 aa9.4□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 E2F3O00716 465 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 B3GALT2O43825 422 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 ALOX12BO75342 701 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 WFS1O76024 890 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 PRB1P04280 392 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 FHP07954 510 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 NUDT17P0C025 328 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 ICAM2P13598 275 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 KRT15P19012 456 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 EPORP19235 508 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 GCAP28676 217 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 GMPRP36959 345 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 PIK3CBP42338 1070 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 TSFMP43897 325 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 KCNC1P48547 511 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 ARFIP1P53367 373 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 NAA20P61599 178 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 VSNL1P62760 191 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 TMEM35AQ53FP2 167 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 KIRREL2Q6UWL6 708 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 QSOX2Q6ZRP7 698 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 PRSS41Q7RTY9 318 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 ZNF605Q86T29 641 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 PDSS2Q86YH6 399 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 LAS2Q8IYD9 372 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 FDCSPQ8NFU4 85 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 ESAMQ96AP7 390 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 CCDC126Q96EE4 140 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 KCNC2Q96PR1 638 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 MACROD1Q9BQ69 325 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 VN1R1Q9GZP7 353 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 LHPPQ9H008 270 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 EPS8L2Q9H6S3 715 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 MLXIPLQ9NP71 852 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 MID2Q9UJV3 735 aa9.39□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 BLACEA4D250 179 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 LRIT2A6NDA9 550 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 ZNF860A6NHJ4 632 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 H0YIV9 168 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 SLC28A2O43868 658 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 OTCP00480 354 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 UQCRHP07919 91 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 PCNAP12004 261 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 COX6A1P12074 109 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 CD22P20273 847 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 CCNG1P51959 295 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 MTTPP55157 894 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 RAB8AP61006 207 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 IFFO1Q0D2I5 559 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 HYAL2Q12891 473 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 EXT1Q16394 746 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 SYT16Q17RD7 645 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 TMEM205Q6UW68 189 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 CHSY3Q70JA7 882 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 KBTBD2Q8IY47 623 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 TEX19Q8NA77 164 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 CAVIN3Q969G5 261 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 MOCOSQ96EN8 888 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 PEX11GQ96HA9 241 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 SERINC2Q96SA4 455 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 TBCDQ9BTW9 1192 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 MS4A8Q9BY19 250 aa9.38□□□□□ -0.91
TIMMDC1-202ENST00000463927 IPPKQ9H8X2 491 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.6 ms