RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GBX1Q14549 363 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ANKDD1AQ495B1 522 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 NSMAFQ92636 917 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FKBP10Q96AY3 582 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TRBC2A0A5B9 178 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 BCL9O00512 1426 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 RNF13O43567 381 aa6.47□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 CDRT1O95170 752 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SLC16A8O95907 504 aa6.47□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 GJB1P08034 283 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ADH5P11766 374 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ARSIQ5FYB1 569 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 COQ8AQ8NI60 647 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ICKQ9UPZ9 632 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 WDR45Q9Y484 360 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 HAS3O00219 553 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PRKYO43930 277 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ADH1BP00325 375 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CFIP05156 583 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 EBLN1P0CF75 366 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 BMP6P22004 513 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 JAM2P57087 298 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ECH1Q13011 328 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TLCD1Q96CP7 247 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PKP4Q99569 1192 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LCHNA4D1U4 455 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FAM170BA6NMN3 283 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LRRTM2O43300 516 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SSX4O60224 188 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GPR143P51810 404 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 DGKEP52429 567 aa6.47□□□□□ -1.37
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USP46-201ENST00000441222 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TRIB2Q92519 343 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 HBEGFQ99075 208 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 RCCD1A6NED2 376 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 BTBD19C9JJ37 291 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TULP2O00295 520 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TOR1BO14657 336 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CREG1O75629 220 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 C7P10643 843 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 RORAP35398 523 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SEC13P55735 322 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MOGQ16653 247 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 S100PBPQ96BU1 408 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 SYT3Q9BQG1 590 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MROQ9BYG7 248 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 EBF3Q9H4W6 596 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 GJE1A6NN92 205 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CCRL2O00421 344 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PHYHO14832 338 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 INMTO95050 263 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 LATS1O95835 1130 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 MSR1P21757 451 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 CLCNKAP51800 687 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 TSTQ16762 297 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.46□□□□□ -1.37
USP46-201ENST00000441222 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.46□□□□□ -1.37
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