RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 OLR1P78380 273 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 DOC2BQ14184 412 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 DMC1Q14565 340 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 LEXMQ3ZCV2 418 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR149Q86SP6 731 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT73Q86Y46 540 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf111Q8N326 155 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP76Q8TAP6 659 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB118Q96PH6 123 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTL8Q9H568 366 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PQY0 241 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GFRA2O00451 464 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 STX16O14662 325 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SMPD1P17405 629 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SSTR2P30874 369 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RORCP51449 518 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVFC1P60507 584 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RBBP7Q16576 425 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 XKR7Q5GH72 579 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 RETSATQ6NUM9 610 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNT10Q86SR1 603 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ATCAYQ86WG3 371 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 OR8K3Q8NH51 312 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 AP2M1Q96CW1 435 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 MTERF3Q96E29 417 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SGTBQ96EQ0 304 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 FOPNLQ96NB1 174 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TREX1Q9NSU2 369 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 DPP7Q9UHL4 492 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 COPS3Q9UNS2 423 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 PLXNA3P51805 1871 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ALG1L2C9J202 215 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ARNTLO00327 626 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PTP4A3O75365 173 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RETP07949 1114 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MMP3P08254 477 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 THEGLP0DJG4 465 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 POU1F1P28069 291 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MATKP42679 507 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 AGTR2P50052 363 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CSNK2BP67870 215 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SSX1Q16384 188 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF284Q2VY69 593 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 DENND1CQ8IV53 801 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF599Q96NL3 588 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK15Q96Q40 435 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PITX2Q99697 317 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CDT1Q9H211 546 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 BRD7Q9NPI1 651 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RGS18Q9NS28 235 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HPF1Q9NWY4 346 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF225Q9UK10 706 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TBX21Q9UL17 535 aa8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51F1A6NGY5 319 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GABRDO14764 452 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FPR1P21462 350 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB14P61106 215 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 BAMBIQ13145 260 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPKAPK3Q16644 382 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms