RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 COG3Q96JB2 828 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP3K3Q99759 626 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 BDH2Q9BUT1 245 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ALG12Q9BV10 488 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 GANQ9H2C0 597 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 TLE6Q9H808 572 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF121Q9H920 327 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 TRPC7Q9HCX4 862 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 PARD6AQ9NPB6 346 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 HPS4Q9NQG7 708 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 AMDHD2Q9Y303 409 aa4.33□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PRB8 838 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ANTXRLA6NF34 631 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM47DPA6NHR8 397 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 E5RGE8 158 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 K7ESM1 405 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CYR61O00622 381 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 PDXKO00764 312 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SYT7O43581 403 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 OR4F21O95013 312 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP1A2P05177 515 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 LIPFP07098 398 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 APRTP07741 180 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CEACAM1P13688 526 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 GM2AP17900 193 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 LMO1P25800 156 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP2R1AP30153 589 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SRD5A2P31213 254 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC6A8P48029 635 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC1A6P48664 564 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CLCN4P51793 760 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 AIF1P55008 147 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ZXDBP98169 803 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXE3Q13461 319 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CDSNQ15517 529 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 AGKQ53H12 422 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CAVIN4Q5BKX8 364 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 FSCBQ5H9T9 825 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SPDYCQ5MJ68 293 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 BNIPLQ7Z465 357 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM131BQ86XD5 332 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM139Q8IV31 216 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC22A9Q8IVM8 553 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CRYBG2Q8N1P7 616 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 BHLHE23Q8NDY6 225 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 GOLGA5Q8TBA6 731 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 AGR3Q8TD06 166 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 GIPC3Q8TF64 312 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM255BQ8WV15 326 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 PHYHIPQ92561 330 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SEPT8Q92599 483 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 AZIN2Q96A70 460 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB39BQ96DA2 213 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 C4orf36Q96KX1 117 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SENP8Q96LD8 212 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 GLRX2Q9NS18 164 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 SMPD4Q9NXE4 827 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CLEC4AQ9UMR7 237 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 NSG2Q9Y328 171 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa4.32□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 FANCAO15360 1455 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ERICH4A6NGS2 130 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 LILRA5A6NI73 299 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC01548A6NM66 108 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 PRRG1O14668 218 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 B4GALT2O60909 372 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CIB2O75838 187 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CPNE6O95741 557 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 IL1BP01584 269 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 EPOP01588 193 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 TFAP2AP05549 437 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 ASGR1P07306 291 aa4.31□□□□□ -1.72
CBX1P4-201ENST00000439415 CA3P07451 260 aa4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms