RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SCN8AQ9UQD0 1980 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 PRRG1O14668 218 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 GKP32189 559 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CDH12P55289 794 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF79Q15937 498 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CHST9Q7L1S5 443 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 OR52J3Q8NH60 311 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SLC7A6Q92536 515 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 MYO19Q96H55 970 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 WDFY2Q96P53 400 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SRRQ9GZT4 340 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF556Q9HAH1 456 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 YIPF1Q9Y548 306 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SLC35F4A4IF30 521 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 LAMP1P11279 417 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ALDH9A1P49189 494 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 C21orf58P58505 322 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CDC42P60953 191 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ZXDBP98169 803 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 RGNQ15493 299 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ALPK3Q96L96 1907 aa14.35□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 A0A1W2PQ09 198 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 C1orf226A1L170 272 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 HLA-EP13747 358 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 TNFRSF1BP20333 461 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CSKP41240 450 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SEMG2Q02383 582 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CDH18Q13634 790 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 IFI44LQ53G44 452 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 OPALINQ96PE5 141 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 DUSP26Q9BV47 211 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CREBZFQ9NS37 354 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 TFECO14948 347 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 MPZL2O60487 215 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 AOAHP28039 575 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SLC6A12P48065 614 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 RORCP51449 518 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 PSPHP78330 225 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 DOC2BQ14184 412 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 GPAT3Q53EU6 434 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 LAX1Q8IWV1 398 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 RNF175Q8N4F7 328 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 IGSF21Q96ID5 467 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CAPNS2Q96L46 248 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 BBS2Q9BXC9 721 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SLC22A4Q9H015 551 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 HHATLQ9HCP6 504 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 BTNL2Q9UIR0 455 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.34□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 PRAMEF4O60810 478 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CCNB2O95067 398 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SCG5P05408 212 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 CA8P35219 290 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 SCN1BQ07699 218 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 PCDH1Q08174 1060 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 HYAL2Q12891 473 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 ASAH1Q13510 395 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 VEPH1Q14D04 833 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.33□□□□□ -0.11
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC66Q68CR7 880 aa14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms