RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 S100GP29377 79 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 CAP1Q01518 475 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 TTLL4Q14679 1199 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 DPYSL2Q16555 572 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 STEAP4Q687X5 459 aa6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 ZNF487B1APH4 448 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 CAPN3P20807 821 aa6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 M0R2N6 131 aa6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 SEC14L5O43304 696 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 MFSD11O43934 449 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 OGDHQ02218 1023 aa6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 OSTF1Q92882 214 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 C10orf53Q8N6V4 93 aa6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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SBNO1-202ENST00000420886 CHADLQ6NUI6 762 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 CLDN22Q8N7P3 220 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.25□□□□□ -1.41
SBNO1-202ENST00000420886 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.25□□□□□ -1.41
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