RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414416.2

LINC00116-201, Transcript of Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00116, Length 2,051 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116-201ENST00000414416 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 STATHP02808 62 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 PTPN4P29074 926 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 KLF10Q13118 480 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 PWP1Q13610 501 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.066e-7■■■□□ 14.8
LINC00116-201ENST00000414416 CAMKVQ8NCB2 501 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 STON2Q8WXE9 905 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 AKTIPQ9H8T0 292 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 BRF2Q9HAW0 419 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 FGF21Q9NSA1 209 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 TAS2R1Q9NYW7 299 aa14.66□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 EFCAB7A8K855 629 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 B2RBV5 119 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 TGFB1P01137 390 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 FOXM1Q08050 763 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 RGS1Q08116 209 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 CUL3Q13618 768 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 TCTE1Q5JU00 501 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 OR6C1Q96RD1 312 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 CCT7Q99832 543 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 NLNQ9BYT8 704 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 OCIAD1Q9NX40 245 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 SERTAD3Q9UJW9 196 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 PPT2Q9UMR5 302 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 SERTM1A2A2V5 107 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 TXNDC9O14530 226 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 P2RX6O15547 441 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 CTSBP07858 339 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 HSD3B1P14060 373 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 HSD3B2P26439 372 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 IMPG1Q17R60 797 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 HKDC1Q2TB90 917 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 CHSY3Q70JA7 882 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 TMPRSS12Q86WS5 348 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 NT5CQ8TCD5 201 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 ACPTQ9BZG2 426 aa14.65□□□□□ -0.06
LINC00116-201ENST00000414416 LRIT2A6NDA9 550 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 SLC28A1O00337 649 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 SH3BGRLO75368 114 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 OR2B3O76000 313 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 HMGCS1Q01581 520 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 MANEAQ5SRI9 462 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 GPR135Q8IZ08 494 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 OR1L3Q8NH93 324 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 MS4A8Q9BY19 250 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 STARD5Q9NSY2 213 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 DLL3Q9NYJ7 618 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 RGS14O43566 566 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 ETHE1O95571 254 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 PIK3R1P27986 724 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 ITGA1P56199 1179 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 HYAL2Q12891 473 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 XKR7Q5GH72 579 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 KCT2Q8NC54 265 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 OR2T11Q8NH01 316 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 SERPINI1Q99574 410 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 CENPKQ9BS16 269 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 OR51B5Q9H339 312 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 RARRES3Q9UL19 164 aa14.64□□□□□ -0.07
LINC00116-201ENST00000414416 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms