RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CAPN1P07384 714 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NUDT17P0C025 328 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CTAGE8P0CG41 777 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF18P17022 549 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FCARP24071 287 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RFC4P35249 363 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GDF5P43026 501 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAGEA11P43364 429 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GLIPR1P48060 266 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SELENOPP49908 381 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MXI1P50539 228 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PGGT1BP53609 377 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CD81P60033 236 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IRX4P78413 519 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TNFRSF17Q02223 184 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADPRMQ3LIE5 342 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC36A3Q495N2 470 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPDYCQ5MJ68 293 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LDLRAP1Q5SW96 308 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NCR3LG1Q68D85 454 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CTAGE6Q86UF2 777 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADGRG3Q86Y34 549 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1orf210Q8IVY1 113 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CTAGE4Q8IX94 777 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CERS5Q8N5B7 392 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR52I2Q8NH67 350 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR4A16Q8NH70 328 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PROKR1Q8TCW9 393 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 WASF1Q92558 559 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HAS2Q92819 552 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NT5C3BQ969T7 300 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPR137Q96N19 417 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRFN5Q96NI6 719 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TSSK2Q96PF2 358 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FICDQ9BVA6 458 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NFKBIZQ9BYH8 718 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VN1R1Q9GZP7 353 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ACTR8Q9H981 624 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ACKR4Q9NPB9 350 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SNX6Q9UNH7 406 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C5P01031 1676 aa3.55□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RGPD2P0DJD1 1756 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZMYM6O95789 1325 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HYKKA2RU49 373 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GAGE12JA6NER3 117 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C5orf60A6NFR6 353 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRR32B1ATL7 298 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF814B7Z6K7 855 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPIPA3F8WFD2 350 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MS4A18H0YCH9 400 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MDM4O15151 490 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VPS26AO75436 327 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ECI2O75521 394 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TOM1L1O75674 476 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR6A2O95222 327 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EPB41P11171 864 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DGKAP23743 735 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PAX7P23759 505 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCR1P32246 355 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTGS2P35354 604 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TNFRSF4P43489 277 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FMO5P49326 533 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RASSF2P50749 326 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MTTPP55157 894 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FKBP1BP68106 108 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TFF2Q03403 129 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HSF2Q03933 536 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SULT2A1Q06520 285 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IL10RBQ08334 325 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LCP2Q13094 533 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SNX1Q13596 522 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 XKR9Q5GH70 373 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FNDC7Q5VTL7 733 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM69BQ5VUD6 431 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNV1Q6PIU1 500 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIM65Q6PJ69 517 aa3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AMIGO1Q86WK6 493 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms