RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 TNFRSF10CO14798 259 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANGPT2O15123 496 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 YKT6O15498 198 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 TNFSF14O43557 240 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRSS23O95084 383 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPX3P22352 226 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCR5P51681 352 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAD23AP54725 363 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 B4GALNT1Q00973 533 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCDH1Q08174 1060 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 DMPKQ09013 629 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 DAG1Q14118 895 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPP1R3AQ16821 1122 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIF19Q2TAC6 998 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 AMZ2Q86W34 360 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 PROSER1Q86XN7 944 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPARTQ8N0X7 666 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 OXR1Q8N573 874 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 AADATQ8N5Z0 425 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 LILRB4Q8NHJ6 448 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 BIRC7Q96CA5 298 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 CSF3RQ99062 836 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 FUNDC2Q9BWH2 189 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 NDEL1Q9GZM8 345 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 MTG2Q9H4K7 406 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 MID1IP1Q9NPA3 183 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A1W2PP55 124 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM172BPA6NC97 362 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGLON5A6NGN9 336 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM233B4DJY2 109 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 FXYD1O00168 92 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC28A1O00337 649 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRT6AP02538 564 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRT6BP04259 564 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 THRBP10828 461 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 NDUFS1P28331 727 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL12AP29459 219 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 AKT2P31751 481 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRT6CP48668 564 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 TPTEP56180 551 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIAA1024LP59773 190 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 PHC1P78364 1004 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDK3Q00526 305 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 CD300CQ08708 224 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 GTF2H2Q13888 395 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 SELPLGQ14242 412 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 GGTA1PQ4G0N0 100 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPATA6LQ8N4H0 392 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 UBE2E3Q969T4 207 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF566Q969W8 418 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 REPS1Q96D71 796 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL21RQ9HBE5 538 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 CYP4F12Q9HCS2 524 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 POLG2Q9UHN1 485 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCTPQ9UKL6 214 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNX6Q9UNH7 406 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 LHX6Q9UPM6 363 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 PI4KAP42356 2102 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 SERTM1A2A2V5 107 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANKRD34BA5PLL1 514 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPINT1O43278 529 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRT75O95678 551 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNAP29O95721 258 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 NPPAP01160 153 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC6A2P23975 617 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 HTR1EP28566 365 aa9.58□□□□□ -0.88
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLCNKAP51800 687 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.5 ms