RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 LAS2Q8IYD9 372 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 SLC5A8Q8N695 610 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 OR4C15Q8NGM1 316 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 SAMD11Q96NU1 681 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 THSD1Q9NS62 852 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 WDR5P61964 334 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 SPIBQ01892 262 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 PDE7AQ13946 482 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC80Q76M96 950 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 OXR1Q8N573 874 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 PPCDCQ96CD2 204 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM38AQ9H6F2 299 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 ARMC7Q9H6L4 198 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 DMRT3Q9NQL9 472 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM184CQ9NVA4 438 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD13-201ENST00000392539 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa25.33■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 GPR37L1O60883 481 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 FGF19O95750 216 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 FURINP09958 794 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 NPPBP16860 134 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 SYN1P17600 705 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PRIM2P49643 509 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PERM1Q5SV97 790 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 RHOXF1Q8NHV9 184 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ALPK3Q96L96 1907 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 A8MVJ9 347 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 SERPINB7O75635 380 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 UGT2B10P36537 528 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TUBA1BP68363 451 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TEKQ02763 1124 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 MICAQ29983 383 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 POM121L1PQ3SYA9 428 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM40Q6P9F5 258 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TUBA1AQ71U36 451 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ARMCX6Q7L4S7 300 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 DNAJC22Q8N4W6 341 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 NFKBIDQ8NI38 313 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 MTG2Q9H4K7 406 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 EHD1Q9H4M9 534 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 MYNNQ9NPC7 610 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 FKBP14Q9NWM8 211 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM247A6NEH6 219 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ALOX5P09917 674 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TNFRSF1BP20333 461 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 GSSP48637 474 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 C2orf80Q0P641 193 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 DEPDC4Q8N2C3 294 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 C16orf78Q8WTQ4 265 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 SGPP1Q9BX95 441 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PIPSLA2A3N6 862 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 KRBA1A5PL33 1030 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 CLCA1A8K7I4 914 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PSMD11O00231 422 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 CDK1P06493 297 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 CLK1P49759 484 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 EPHA5P54756 1037 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 CASP9P55211 416 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 CDH12P55289 794 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 BCL7AQ4VC05 210 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 LGI4Q8N135 537 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 ITPKCQ96DU7 683 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 C1GALT1Q9NS00 363 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 SPASTQ9UBP0 616 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TRIM17Q9Y577 477 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM221A6NGB7 291 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 MOSPD3O75425 235 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 IFNA14P01570 189 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 LIPAP38571 399 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 IFITM3Q01628 133 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PAGE2Q7Z2X7 111 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 CFAP206Q8IYR0 622 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 GGHQ92820 318 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 MTERF3Q96E29 417 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TCF25Q9BQ70 676 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 DCSTAMPQ9H295 470 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 MARK1Q9P0L2 795 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 SH2B3Q9UQQ2 575 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 LRRK1Q38SD2 2015 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 TGFB1P01137 390 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 GBAP04062 536 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD13-201ENST00000392539 OR1E2P47887 323 aa25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms