RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378156.8

NPHP4-201, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP4, Length 4,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-201ENST00000378156 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 NUDT6P53370 316 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 OR4D2P58180 307 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 TIGD6Q17RP2 521 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.096e-10■■■■■ 48.2
NPHP4-201ENST00000378156 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 PLAGL1Q9UM63 463 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.51□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ENTPD1P49961 510 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 LGI4Q8N135 537 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 PMEPA1Q969W9 287 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 A0A1W2PP55 124 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 MID1O15344 667 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 AGR2O95994 175 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 GRK6P43250 576 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 DCDC1P59894 354 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF613Q6PF04 617 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 PAQR9Q6ZVX9 377 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 NPAS3Q8IXF0 933 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 MZB1Q8WU39 189 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 SNX33Q8WV41 574 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CPED1A4D0V7 1026 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 NME4O00746 187 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 KCNA5P22460 613 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CD70P32970 193 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ATP6AP1Q15904 470 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CST9Q5W186 159 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF773Q6PK81 442 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ISOC1Q96CN7 298 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CAPN3P20807 821 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 GRIA2P42262 883 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 GATA6Q92908 595 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.5□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 LAMB1P07942 1786 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 H7BY64 318 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ACOX3O15254 700 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 SNAPC5O75971 98 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 GIMD1P0DJR0 217 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 KCNAB2Q13303 367 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CTC1Q2NKJ3 1217 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 SPATS1Q496A3 300 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CEACAM20Q6UY09 585 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 BTN2A1Q7KYR7 527 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 SMOXQ9NWM0 555 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 SLC15A1P46059 708 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CBLBQ13191 982 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 KDELC1Q6UW63 502 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 OARD1Q9Y530 152 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 NOTOA8MTQ0 251 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 SLC16A5O15375 505 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 MPC1LP0DKB6 136 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 NTHL1P78549 312 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 GPR68Q15743 365 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 TMIEQ8NEW7 156 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 FAM83CQ9BQN1 747 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.49□□□□□ -0.09
NPHP4-201ENST00000378156 CDH7Q9ULB5 785 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms