RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 STK4Q13043 487 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SLC39A6Q13433 755 aa3.38□□□□□ -1.87
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PTPRC-202ENST00000367364 RPS6KA1Q15418 735 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SLC15A2Q16348 729 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PFKFB4Q16877 469 aa3.38□□□□□ -1.87
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PTPRC-202ENST00000367364 CCDC58Q4VC31 144 aa3.38□□□□□ -1.87
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PTPRC-202ENST00000367364 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
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PTPRC-202ENST00000367364 SLC29A1Q99808 456 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GON7Q9BXV9 100 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PITPNM3Q9BZ71 974 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NUF2Q9BZD4 464 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NT5C3AQ9H0P0 336 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SNX25Q9H3E2 840 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 C10orf88Q9H8K7 445 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SIAEQ9HAT2 523 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TAS2R7Q9NYW3 318 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 EPS15L1Q9UBC2 864 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 FETUBQ9UGM5 382 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SLC7A8Q9UHI5 535 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 AMACRQ9UHK6 382 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 POLG2Q9UHN1 485 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 KLK13Q9UKR3 277 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 EXOC7Q9UPT5 735 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CPQQ9Y646 472 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SCN11AQ9UI33 1791 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GLI3P10071 1580 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 FLT4P35916 1363 aa3.38□□□□□ -1.87
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PTPRC-202ENST00000367364 TECPR2O15040 1411 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 COL24A1Q17RW2 1714 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-202ENST00000367364 GOLGA8OA6NCC3 632 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 FAM47DPA6NHR8 397 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-202ENST00000367364 H3BNH8 94 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GOLGA8RI6L899 631 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 AP3B1O00203 1094 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-202ENST00000367364 CDH16O75309 829 aa3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-202ENST00000367364 FTCDO95954 541 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 RPN1P04843 607 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
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PTPRC-202ENST00000367364 IL9RQ01113 521 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PRKCEQ02156 737 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
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