RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365426.1

RNU6-1335P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1335, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1335P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GPRIN2O60269 458 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ATP9AO75110 1047 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GMNNO75496 209 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GAS8-AS1O95177 125 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OR6A2O95222 327 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 WDPCPO95876 746 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLGP00747 810 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TSHBP01222 138 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGKV3-15P01624 115 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 IGHV3-13P01766 116 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SBK2P0C263 348 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CTAGE8P0CG41 777 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TSPY4P0CV99 314 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TSPY10P0CW01 314 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GP1BBP13224 206 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 P4HA1P13674 534 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PLA2G2AP14555 144 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 AKR1B1P15121 316 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EZRP15311 586 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CYP11B1P15538 503 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CD1DP15813 335 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ITIH1P19827 911 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTAFRP25105 342 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ANXA13P27216 316 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NTSP30990 170 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MC5RP33032 325 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CTNNB1P35222 781 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRT2P35908 639 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FEN1P39748 380 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DCTP40126 519 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SOX3P41225 446 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MATKP42679 507 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 SLC1A4P43007 532 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NSFP46459 744 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TAF6P49848 677 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EMDP50402 254 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HLCSP50747 726 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MNAT1P51948 309 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 METAP1P53582 386 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 NAPAP54920 295 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MFAP3P55082 362 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PEX3P56589 373 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ERVPABLB-1P60509 514 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ST8SIA6P61647 398 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RBP5P82980 135 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCZ1BP86790 482 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ACY1Q03154 408 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARHGAP1Q07960 439 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CD47Q08722 323 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ACSM1Q08AH1 577 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C17orf67Q0P5P2 114 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RUNX3Q13761 415 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ARFRP1Q13795 201 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CEACAM7Q14002 265 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM187Q14656 261 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TMEM132DQ14C87 1099 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HERC3Q15034 1050 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 FCN2Q15485 313 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 STXBP2Q15833 593 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTGISQ16647 500 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CA9Q16790 459 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MICAQ29983 383 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HYAL4Q2M3T9 481 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C15orf32Q32M92 178 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ALDH1L2Q3SY69 923 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CCDC40Q4G0X9 1142 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF542PQ5EBM4 170 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C6orf136Q5SQH8 315 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 GRTP1Q5TC63 336 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RTL6Q6ICC9 239 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PAQR6Q6TCH4 344 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CD164L2Q6UWJ8 174 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 OLFM4Q6UX06 510 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 C2orf66Q6UXQ4 117 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 RAD9BQ6WBX8 426 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF730Q6ZMV8 503 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 ZNF841Q6ZN19 808 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 UTS2BQ765I0 119 aa0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP0.75□□□□□ -2.29
RNU6-1335P-201ENST00000365426 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms