RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 LRFN1Q9P244 771 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DCTN4Q9UJW0 460 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 STOML2Q9UJZ1 356 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 COL4A6Q14031 1691 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NLRC5Q86WI3 1866 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MED13LQ71F56 2210 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FADS2P1A8MWK0 482 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS44E7EML9 344 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 UBXN8O00124 270 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CCL21O00585 134 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RASAL1O95294 804 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SHBGP04278 402 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KLK1P06870 262 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MPIP34949 423 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V1E1P36543 226 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CPOXP36551 454 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KCNK10P57789 538 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RPL38P63173 70 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KLRB1Q12918 225 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ATP1A4Q13733 1029 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KRT72Q14CN4 511 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RASA2Q15283 850 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MSS51Q4VC12 460 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM259Q4ZIN3 620 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRAMEF20Q5VT98 475 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PRMT9Q6P2P2 845 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SFTPA2Q8IWL1 248 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CADM2Q8N3J6 435 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 BCORP1Q8N888 145 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ANKS4BQ8N8V4 417 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FAM76AQ8TAV0 307 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NXNL1Q96CM4 212 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PPM1MQ96MI6 270 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 SLC46A1Q96NT5 459 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 F2RL3Q96RI0 385 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MAT2BQ9NZL9 334 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OGFRQ9NZT2 677 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 STK38LQ9Y2H1 464 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRDP23468 1912 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 POLQO75417 2590 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LILRA5A6NI73 299 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 K7EPI3 171 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 UNC5CO95185 931 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NR2F6P10588 404 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FOLR1P15328 257 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MAN2A2P49641 1150 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 XKP51811 444 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 EFNA3P52797 238 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DPTQ07507 201 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DECR1Q16698 335 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RANBP10Q6VN20 620 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NEK10Q6ZWH5 1172 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MREGQ8N565 214 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DDHD1Q8NEL9 900 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LRGUKQ96M69 825 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 COQ10AQ96MF6 247 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF778Q96MU6 729 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR1F2PQ96R84 312 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 NDEL1Q9GZM8 345 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 Q9N2J8 555 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IL17BQ9UHF5 180 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 DHRS7Q9Y394 339 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 TIMM22Q9Y584 194 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ANKUB1A6NFN9 424 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FIGNL2A6NMB9 653 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 PROB1E7EW31 1015 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CHST10O43529 356 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CBSLP0DN79 551 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CNTFP26441 200 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CBSP35520 551 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 HNMTP50135 292 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 LRIG3Q6UXM1 1119 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 IKBIPQ70UQ0 350 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KMT5CQ86Y97 462 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF100Q8IYN0 542 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 CNPY4Q8N129 248 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 OR4K14Q8NGD5 310 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 KCNJ9Q92806 393 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 MTBPQ96DY7 904 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 FCRL4Q96PJ5 515 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRC-201ENST00000348564 RMND5AQ9H871 391 aa4.24□□□□□ -1.73
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