RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 OR6C74A6NCV1 312 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 A6NJY4 79 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TLR4O00206 839 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SLC28A1O00337 649 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SLC22A2O15244 555 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 LAMTOR5O43504 91 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ULK1O75385 1050 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 WFS1O76024 890 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 UNC5CO95185 931 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PDYNP01213 254 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PRR35P0CG20 571 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CD22P20273 847 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 BLKP51451 505 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 NCALDP61601 193 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RHAGQ02094 409 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 GRHL2Q6ISB3 625 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SPATA24Q86W54 205 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 OR52E1Q8NGJ3 308 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 C1orf216Q8TAB5 229 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TAAR2Q9P1P5 351 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ICKQ9UPZ9 632 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 KCNE2Q9Y6J6 123 aa5.82□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PEX11AO75192 247 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 KRT6AP02538 564 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 KRT6BP04259 564 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 F3P13726 295 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CTSEP14091 401 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 LBPP18428 481 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 GNAZP19086 355 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RASSF2P50749 326 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ATP4BP51164 291 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 KLF10Q13118 480 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TIGD6Q17RP2 521 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ATG9BQ674R7 924 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SPATA19Q7Z5L4 167 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SFRP1Q8N474 314 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 OR2L8Q8NGY9 312 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SLC5A11Q8WWX8 675 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 DNASE2BQ8WZ79 361 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 WDR34Q96EX3 536 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 XKR8Q9H6D3 395 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RUBCNLQ9H714 662 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 HPF1Q9NWY4 346 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CCL27Q9Y4X3 112 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PPV9 198 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SERTM1A2A2V5 107 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RGS14O43566 566 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 JUNDP17535 347 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CCNA2P20248 432 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CALB2P22676 271 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PIK3R1P27986 724 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 NDUFS1P28331 727 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PRDX6P30041 224 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 HNF4AP41235 474 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RAB28P51157 221 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RELAQ04206 551 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZSR9 355 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TMPRSS11BQ86T26 416 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 GIPC3Q8TF64 312 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SMPDL3AQ92484 453 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CXorf40BQ96DE9 158 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 HBEGFQ99075 208 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ZPBPQ9BS86 351 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 LRRC61Q9BV99 259 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 PCBD2Q9H0N5 130 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ELOVL6Q9H5J4 265 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 SHOXO15266 292 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 CSF2P04141 144 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CCR6-201ENST00000341935 RCVRNP35243 200 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms