RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 RIMKLAQ8IXN7 391 aa18.76■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa18.76■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 TESCQ96BS2 214 aa18.76■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 NUDT22Q9BRQ3 303 aa18.76■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 NLNQ9BYT8 704 aa18.76■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 MYNNQ9NPC7 610 aa18.76■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.76■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM9Q9P0T7 183 aa18.76■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 CUL9Q8IWT3 2517 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 EEDO75530 441 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 CPNE6O95741 557 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 GBAP04062 536 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 CAPN3P20807 821 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 GSTM5P46439 218 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 CCL7P80098 99 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 SPEM2Q0P670 501 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 COQ5Q5HYK3 327 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 CSNK1A1LQ8N752 337 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 KCT2Q8NC54 265 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 RCN3Q96D15 328 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 EDEM2Q9BV94 578 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 C1orf21Q9H246 121 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 LRRN3Q9H3W5 708 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 EFCAB1Q9HAE3 211 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 SEMA4GQ9NTN9 838 aa18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 A0A1W2PP18 115 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 A0A1W2PQM1 296 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC154A6NI56 674 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 C4orf51C9J302 202 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 TXNDC9O14530 226 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 ANGPT2O15123 496 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 IL6P05231 212 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 CKMT2P17540 419 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 GABRA4P48169 554 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 MAPK12P53778 367 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 HSD11B2P80365 405 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 MXRA7P84157 204 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 DPY19L1Q2PZI1 675 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 HKDC1Q2TB90 917 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 DEFB110Q30KQ9 67 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 MMEL1Q495T6 779 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 VPS26BQ4G0F5 336 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 RINLQ6ZS11 566 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 IKBIPQ70UQ0 350 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 ASRGL1Q7L266 308 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 CDC26Q8NHZ8 85 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 C16orf78Q8WTQ4 265 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 KLHL29Q96CT2 875 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 BTBD10Q9BSF8 475 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 ROGDIQ9GZN7 287 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 PRDM7Q9NQW5 492 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 TAS2R1Q9NYW7 299 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 PLCL2Q9UPR0 1127 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 NDUFAF1Q9Y375 327 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 DMDP11532 3685 aa18.74■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 A0A0A6YYD5 115 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 FBP2O00757 339 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 AIM2O14862 343 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 CFLARO15519 480 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 HCRTR1O43613 425 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 KLHL18O94889 574 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 LRATO95237 230 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 HPCAL1P37235 193 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 NBL1P41271 181 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 CSRP2Q16527 193 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 TIGD2Q4W5G0 525 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 REP15Q6BDI9 236 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF793Q6ZN11 406 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 ABHD13Q7L211 337 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 OR4D9Q8NGE8 314 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 FBXO27Q8NI29 283 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 RHBDD1Q8TEB9 315 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 SLC41A2Q96JW4 573 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF285Q96NJ3 590 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM9BQ9NQ34 198 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 NCDNQ9UBB6 729 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 FTSJ1Q9UET6 329 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 A0A0G2JN53 185 aa18.73■□□□□ 0.59
CCDC71-201ENST00000321895 AKAP10O43572 662 aa18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.8 ms