RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 TRIM17Q9Y577 477 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 H3BM21 787 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 AIREO43918 545 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 KLK1P06870 262 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ELFN1P0C7U0 828 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 NPPBP16860 134 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 SERPINB10P48595 397 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 TAS2R50P59544 299 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 COLEC12Q5KU26 742 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 CADM3Q8N126 398 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 MRGPRX3Q96LB0 322 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 IL17FQ96PD4 163 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ITPAQ9BY32 194 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ROGDIQ9GZN7 287 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 BRF2Q9HAW0 419 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 SPHK2Q9NRA0 654 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 PADI2Q9Y2J8 665 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 PRKAB1Q9Y478 270 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 CCDC88CQ9P219 2028 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 HSMCR30P0CW71 290 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 GGT2P36268 569 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 S100ZQ8WXG8 99 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ACAT2Q9BWD1 397 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 GABARAPL3Q9BY60 117 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 OR2AG1Q9H205 316 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 DSN1Q9H410 356 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 REEP4Q9H6H4 257 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ABCB10Q9NRK6 738 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF226Q9NYT6 803 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 NINQ8N4C6 2090 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 PRAMEF10O60809 474 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 KLHL18O94889 574 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ITGB8P26012 769 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 SLC13A2Q13183 592 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 TIGD6Q17RP2 521 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 SLC5A12Q1EHB4 618 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 SPIN4Q56A73 249 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 LIPIQ6XZB0 460 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 SLC22A16Q86VW1 577 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 SLC38A4Q969I6 547 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ZBP1Q9H171 429 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 TNFRSF21O75509 655 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 C1orf105O95561 183 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 SYN1P17600 705 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 RPS26P62854 115 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 VN1R2Q8NFZ6 395 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ZSWIM3Q96MP5 696 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 FOPNLQ96NB1 174 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 RNF208Q9H0X6 261 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 FBXO8Q9NRD0 319 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 IL36AQ9UHA7 158 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 OSGIN1Q9UJX0 560 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 RAB23Q9ULC3 237 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 WASH3PC4AMC7 463 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 PRLHRP49683 370 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 GCNT6Q5T4J0 391 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 LILRA6Q6PI73 481 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 DNAJC22Q8N4W6 341 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 FAM210AQ96ND0 272 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 DACH2Q96NX9 599 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 OR51E2Q9H255 320 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ADRA2AP08913 450 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 C21orf58P58505 322 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF763Q0D2J5 394 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 MESP2Q0VG99 397 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 IFI44LQ53G44 452 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 UBE2UQ5VVX9 321 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 C16orf78Q8WTQ4 265 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM39AQ9NV64 488 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 SNX8Q9Y5X2 465 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 HIDE1A8MVS5 230 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 PTHP01270 115 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 CSF2RAP15509 400 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 TGM1P22735 817 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 SEPHS1P49903 392 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 ING5Q8WYH8 240 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 PPCDCQ96CD2 204 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 TDP1Q9NUW8 608 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 E9PQ18 207 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXB3-201ENST00000311626 HSD3B1P14060 373 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms