RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308020.5

PTDSS2-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS2, Length 2,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-201ENST00000308020 DNAJC22Q8N4W6 341 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 OR10G2Q8NGC3 310 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CHTF18Q8WVB6 975 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM159Q96B96 161 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 COQ8BQ96D53 544 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM165Q9HC07 324 aa20.16■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 EFCAB14O75071 495 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 HSD3B1P14060 373 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 HSD3B2P26439 372 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 IMPA1P29218 277 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CDH12P55289 794 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 HBA1P69905 142 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ATL1Q8WXF7 558 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 FCGR1BQ92637 280 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 GGHQ92820 318 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PKP4Q99569 1192 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 GPR83Q9NYM4 423 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 M0R129 80 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ADAMDEC1O15204 470 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 KDM1AO60341 852 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PTPN2P17706 415 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 MVDP53602 400 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SPIBQ01892 262 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 GRIN2CQ14957 1233 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 TEAD4Q15561 434 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF404Q494X3 552 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CAMKMTQ7Z624 323 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 HPS1Q92902 700 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 NEIL2Q969S2 332 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ITM2BQ9Y287 266 aa20.15■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CLCA1A8K7I4 914 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 DBTP11182 482 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SYN1P17600 705 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.829e-6■□□□□ 8.2
PTDSS2-201ENST00000308020 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 CTSKP43235 329 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC13A2Q13183 592 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF284Q2VY69 593 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 COLEC12Q5KU26 742 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 MYDGFQ969H8 173 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 SPASTQ9UBP0 616 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 IL36AQ9UHA7 158 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.14■□□□□ 0.82
PTDSS2-201ENST00000308020 NOTCH4Q99466 2003 aa20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 PRAMEF25A6NGN4 478 aa20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 AP2A2O94973 939 aa20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 CATP04040 527 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 CDK1P06493 297 aa20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 STSP08842 583 aa20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 PDHA2P29803 388 aa20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 GRK5P34947 590 aa20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 TMED10P49755 219 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 DCDC1P59894 354 aa20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 SPIN4Q56A73 249 aa20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 ING5Q8WYH8 240 aa20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF229Q9UJW7 825 aa20.14■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 SAP18O00422 153 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 C6orf47O95873 294 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 MC1RQ01726 317 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 DMC1Q14565 340 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 ZNF77Q15935 545 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 LGI4Q8N135 537 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 NFKBIDQ8NI38 313 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 RNF167Q9H6Y7 350 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 PTPRSQ13332 1948 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 J3KTA2 159 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 NPC1O15118 1278 aa20.13■□□□□ 0.81
PTDSS2-201ENST00000308020 POU2F1P14859 743 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms