RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCD2Q9UBJ2 740 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 DIO3P55073 304 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 PIGFQ07326 219 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 TPRG1Q6ZUI0 275 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 OR5J2Q8NH18 312 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 Q9N2J8 555 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 PLAGL1Q9UM63 463 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 M0R233 179 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 VNN2O95498 520 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 HPRP00739 348 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 ST3GAL4Q11206 333 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPRCAPQ14761 206 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 MEDAGQ5VYS4 303 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM53CQ9NYF3 392 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 GRHPRQ9UBQ7 328 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SNAPC5O75971 98 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP27C1Q4G0S4 372 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SPRYD7Q5W111 196 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC29A4Q7RTT9 530 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHO2Q8TD55 490 aa23.36■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 UPK3BL1B0FP48 263 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 UPK3BL2E5RIL1 263 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEA8P43361 318 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 E2F1Q01094 437 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATC1Q76KD6 591 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 C12orf42Q96LP6 360 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC34A8MYJ7 566 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNAB2Q13303 367 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 PTGR1Q14914 329 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 NPY6RQ99463 290 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAMEF11O60813 436 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 MOGSQ13724 837 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 AMZ1Q400G9 498 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNH6Q9H252 994 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 ERVK-18Q9QC07 812 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 VILLO15195 856 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SERINC3Q13530 473 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAM2Q15035 370 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 XKRXQ6PP77 449 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 OVCA2Q8WZ82 227 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 EXTL2Q9UBQ6 330 aa23.35■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 FLRT2O43155 660 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 ADH5P11766 374 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNC3Q14003 757 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 TCEAL1Q15170 157 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 MARVELD2Q8N4S9 558 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPEARQ8WU66 669 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SMURF1Q9HCE7 757 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM64CA6NLI5 447 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 B4DGG1 531 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 HCKP08631 526 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 ERP29P30040 261 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF763Q0D2J5 394 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 C6orf136Q5SQH8 315 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF382Q96SR6 550 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 MEAF6Q9HAF1 191 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGA5P08648 1049 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 HOXD13P35453 343 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF81P51508 661 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 ATG9BQ674R7 924 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 HCAR2Q8TDS4 363 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SDHDO14521 159 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 RP2O75695 350 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL10P27635 214 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 EFR3AQ14156 821 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNJ9Q92806 393 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SMOQ99835 787 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC14AQ9UNH5 594 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SH2B3Q9UQQ2 575 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 UQCRC2P22695 453 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 OR8S1Q8NH09 359 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 FCAMRQ8WWV6 532 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 LAMP5Q9UJQ1 280 aa23.34■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GVC2 190 aa23.33■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 CDKL4Q5MAI5 379 aa23.33■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa23.33■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 PLA2G15Q8NCC3 412 aa23.33■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 TTTY10Q9BZA0 68 aa23.33■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIA2P42262 883 aa23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms